RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466192.5

COL9A3-205, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 2

Gene COL9A3, Length 2,194 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-205ENST00000466192 MYL1P05976 194 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 GRB10Q13322 594 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 CALML4Q96GE6 196 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 RAB34Q9BZG1 259 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.53■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 PLA2G6O60733 806 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 CYP3A7P24462 503 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 ARHGAP4P98171 946 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 MCTP2Q6DN12 878 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 CCDC174Q6PII3 467 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 MBOAT7Q96N66 472 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 PNMA5Q96PV4 448 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 SPATA1Q5VX52 437 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 VSTM4Q8IW00 320 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 GDAQ9Y2T3 454 aa20.52■□□□□ 0.88
COL9A3-205ENST00000466192 DOCK1Q14185 1865 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 COBLO75128 1261 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 UIMC1Q96RL1 719 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FEZ1Q99689 392 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FEM1BQ9UK73 627 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PIK3CDO00329 1044 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KCNB1Q14721 858 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FAM160B2Q86V87 743 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.51■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 USP27XA6NNY8 438 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 MARCH6O60337 910 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SREBF1P36956 1147 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TRIM9Q9C026 710 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.5■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 H7C1D1 291 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 UQCRHP07919 91 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 INPP5BP32019 993 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TRAF1Q13077 416 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KRT79Q5XKE5 535 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TBC1D5Q92609 795 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 RHOBTB3O94955 611 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PRCPP42785 496 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.49■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 DGKZQ13574 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 LENG9Q96B70 501 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 STK17AQ9UEE5 414 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FAM86B1E9PN63 330 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PAK1Q13153 545 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 ECM1Q16610 540 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PRR16Q569H4 304 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.48■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 CFBP00751 764 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 MCM6Q14566 821 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 Q4G0T1 1027 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SV2BQ7L1I2 683 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 KCNK18Q7Z418 384 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 NELFBQ8WX92 580 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 GINM1Q9NU53 330 aa20.47■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 LMNB1P20700 586 aa20.46■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 AMPD3Q01432 767 aa20.46■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 SEMA3FQ13275 785 aa20.46■□□□□ 0.87
COL9A3-205ENST00000466192 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms