RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 EDNRBP24530 442 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 NEK4P51957 841 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 RCAN1P53805 252 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 TRAF1Q13077 416 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.65■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 EVCP57679 992 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 VTA1Q9NP79 307 aa23.64■■□□□ 1.38
PTX4-203ENST00000447419 KBTBD13C9JR72 458 aa23.64■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 DNM1LO00429 736 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.64■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 NR3C2P08235 984 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 COPS5Q92905 334 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 STXBP3O00186 592 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 SORBS3O60504 671 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 COL6A1P12109 1028 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 GHRHRQ02643 423 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 RNF180Q86T96 592 aa23.62■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.62■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 PPP2R5BQ15173 497 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 STXBP2Q15833 593 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 NECAB1Q8N987 351 aa23.61■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 KCNA10Q16322 511 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 B4DLN1 442 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 GNASQ5JWF2 1037 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 KIF2CQ99661 725 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 CTAGE5O15320 804 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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PTX4-203ENST00000447419 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 TMEM260Q9NX78 707 aa23.59■■□□□ 1.37
PTX4-203ENST00000447419 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.58■■□□□ 1.36
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PTX4-203ENST00000447419 SPC25Q9HBM1 224 aa23.58■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 EVI5O60447 810 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTX4-203ENST00000447419 CAPN2P17655 700 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 CCND2P30279 289 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 ADCY7P51828 1080 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 ME3Q16798 604 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 AIFM3Q96NN9 605 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.57■■□□□ 1.36
PTX4-203ENST00000447419 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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