RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYH4Q9Y623 1939 aa10.47□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-202ENST00000444658 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARHGAP4P98171 946 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TYRO3Q06418 890 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPIL2Q13356 520 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2SQ16763 222 aa10.46□□□□□ -0.74
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 REPS2Q8NFH8 660 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAGEF1Q9HAY2 307 aa10.46□□□□□ -0.74
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ANO10Q9NW15 660 aa10.46□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.46□□□□□ -0.74
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CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR90Q96KV7 1748 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 IRF6O14896 467 aa10.45□□□□□ -0.74
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CCNDBP1-202ENST00000444658 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIML1Q8N9V2 468 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 EPSTI1Q96J88 318 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYH6P13533 1939 aa10.45□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNAP25P60880 206 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.743e-14■□□□□ 8.1
CCNDBP1-202ENST00000444658 STX1AQ16623 288 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC174Q6PII3 467 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 USP49Q70CQ1 688 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIPA1Q7RTP0 329 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAS1Q92839 578 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.44□□□□□ -0.74
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.44□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAFGO15525 162 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMC2O95347 1197 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFBP00751 764 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCRP11274 1271 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 NLRP12P59046 1061 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 POSTNQ15063 836 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPECC1Q5M775 1068 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 HYIQ5T013 277 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHST13Q8NET6 341 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAGE5Q96GU1 130 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 DISC1Q9NRI5 854 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRWD1Q9UFC0 647 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 FZD1Q9UP38 647 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPTORQ8N122 1335 aa10.43□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MEIS1O00470 390 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC37A4O43826 429 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TDP2O95551 362 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUTP22033 750 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 COPB2P35606 906 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TECP42680 631 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TXKP42681 527 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMPD3Q01432 767 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKG1Q13976 671 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP55Q53EZ4 464 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETNPPLQ8TBG4 499 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBC1D5Q92609 795 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 LENG9Q96B70 501 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 RRAGCQ9HB90 399 aa10.42□□□□□ -0.74
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