RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 IWS1Q96ST2 819 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PXMP2Q9NR77 195 aa20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 SMPD1P17405 629 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 SPC25Q9HBM1 224 aa20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 GJA9P57773 515 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 CUL5Q93034 780 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 IL17RAQ96F46 866 aa20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 MYADML2A6NDP7 307 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 NR3C2P08235 984 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PTGS1P23219 599 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 STXBP2Q15833 593 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 TLK2Q86UE8 772 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.77■□□□□ 0.92
HERC3-205ENST00000426683 PIK3CDO00329 1044 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 MEIS2O14770 477 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 EVI5O60447 810 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PGM5Q15124 567 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 SCFD2Q8WU76 684 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 FERMT2Q96AC1 680 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PHF24Q9UPV7 400 aa20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NAPAP54920 295 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NTRK3Q16288 839 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 KCNA10Q16322 511 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PHKBQ93100 1093 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 Q9Y3F1 56 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.75■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 CTAGE5O15320 804 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ACLYP53396 1101 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NKX3-2P78367 333 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 BEX3Q00994 111 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 STK3Q13188 491 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 GNASQ5JWF2 1037 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 IL31RAQ8NI17 732 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 BARHL2Q9NY43 387 aa20.74■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 STXBP3O00186 592 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PPFIA3O75145 1194 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ARIH2O95376 493 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 SCG2P13521 617 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 IFNAR1P17181 557 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 CCND2P30279 289 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 AK2P54819 239 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 TTLL4Q14679 1199 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD1Q15327 319 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 UBE2SQ16763 222 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.73■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQY0 241 aa20.72■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 ASGR1P07306 291 aa20.72■□□□□ 0.91
HERC3-205ENST00000426683 NEK4P51957 841 aa20.72■□□□□ 0.91
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