RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC24BO95487 1268 aa28.87■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GJA9P57773 515 aa28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GHRHRQ02643 423 aa28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNA10Q16322 511 aa28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.87■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 PXMP2Q9NR77 195 aa28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF24Q9UPV7 400 aa28.87■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 BEX3Q00994 111 aa28.86■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 FBXL16Q8N461 479 aa28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD3Q8N6K7 520 aa28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 IWS1Q96ST2 819 aa28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.86■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.86■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 NR3C2P08235 984 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 FUT2Q10981 343 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT14Q6ZU15 432 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TLK2Q86UE8 772 aa28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.84■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
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HTATSF1-202ENST00000425695 RCAN1P53805 252 aa28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 STXBP2Q15833 593 aa28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1W2PQY0 241 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE5O15320 804 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 SCFD2Q8WU76 684 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 RTP1P59025 263 aa28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.82■■■□□ 2.2
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HTATSF1-202ENST00000425695 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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HTATSF1-202ENST00000425695 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R5BQ15173 497 aa28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
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HTATSF1-202ENST00000425695 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 Q9Y3F1 56 aa28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 ARIH2O95376 493 aa28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PGM5Q15124 567 aa28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.8■■■□□ 2.2
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPFIA3O75145 1194 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 ANAPC15P60006 121 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL4Q14679 1199 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM60Q495X7 471 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.79■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 EVCP57679 992 aa28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 NKX3-2P78367 333 aa28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 LY6KQ17RY6 165 aa28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 VSIG10LQ86VR7 867 aa28.78■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 CCND2P30279 289 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 NAPAP54920 295 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE2SQ16763 222 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 GLT1D1Q96MS3 346 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.77■■■□□ 2.2
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3CDO00329 1044 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 ZEB2O60315 1214 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 STK3Q13188 491 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 SNX17Q15036 470 aa28.76■■■□□ 2.19
HTATSF1-202ENST00000425695 C8orf34Q49A92 452 aa28.76■■■□□ 2.19
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