RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FIBPO43427 364 aa19.28■□□□□ 0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC39A14Q15043 492 aa19.28■□□□□ 0.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABRAQ8N0Z2 381 aa19.28■□□□□ 0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.28■□□□□ 0.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa19.24■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR142Q7Z601 462 aa19.24■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.24■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.24■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4DLN1 442 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF76P36508 570 aa19.23■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PGM5Q15124 567 aa19.23■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 Q4G0T1 1027 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TDP2O95551 362 aa19.22■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCND2P30279 289 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 ME1P48163 572 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 C4orf32Q8N8J7 132 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF186Q9NXI6 227 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 UBXN2AP68543 259 aa19.21■□□□□ 0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GRB14Q14449 540 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFKBIBQ15653 356 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP55Q53EZ4 464 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 NIPA1Q7RTP0 329 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 FERMT2Q96AC1 680 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOWAHBA6NEL2 793 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM86B1E9PN63 330 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBX3O15119 743 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC37A4O43826 429 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGK2P07205 417 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM86B2P0C5J1 330 aa19.2■□□□□ 0.66
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