RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 CASP1P29466 404 aa23.68■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 UBA7P41226 1012 aa23.68■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 FLOT1O75955 427 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CFBP00751 764 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 POTEIP0CG38 1075 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 POTEJP0CG39 1038 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 HMGCS2P54868 508 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 VGLL4Q14135 290 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 MORC3Q14149 939 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 SMARCE1Q969G3 411 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.67■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 C19orf81C9J6K1 198 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 ADCY5O95622 1261 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 POLR2MP0CAP2 368 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CIITAP33076 1130 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 MAP3K9P80192 1104 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 PDIA5Q14554 519 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CABP7Q86V35 215 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 STAMQ92783 540 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 GJA10Q969M2 543 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 LENG9Q96B70 501 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CYP3A4P08684 503 aa23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 FAM86B1E9PN63 330 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 STAT6P42226 847 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 WNK4Q96J92 1243 aa23.65■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 GHRHRQ02643 423 aa23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 NCAPHQ15003 741 aa23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 Q4G0T1 1027 aa23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
GPC1-202ENST00000420138 POTEMA6NI47 508 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 VWA5AO00534 786 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PLCG1P19174 1290 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 HSD17B4P51659 736 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ATG4CQ96DT6 458 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PLIN2Q99541 437 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 NFIBO00712 420 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 SMC2O95347 1197 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CUL4BQ13620 913 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CPXCR1Q8N123 301 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 REPS2Q8NFH8 660 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CSADQ9Y600 493 aa23.63■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 GRB10Q13322 594 aa23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PNMA5Q96PV4 448 aa23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 GSDMAQ96QA5 445 aa23.62■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 BECN2A8MW95 431 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PRR16Q569H4 304 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PTPRFP10586 1907 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 FDX1P10109 184 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 DSG3P32926 999 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PLCB2Q00722 1185 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 CUEDC2Q9H467 287 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 COL20A1Q9P218 1284 aa23.61■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 TBX3O15119 743 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ZBED4O75132 1171 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 UIMC1Q96RL1 719 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 RAB34Q9BZG1 259 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 RLFQ13129 1914 aa23.6■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 PARP14Q460N5 1801 aa23.59■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 IKBKBO14920 756 aa23.59■■□□□ 1.37
GPC1-202ENST00000420138 ALAS1P13196 640 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms