RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413497.5

ANKRD54-205, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-205ENST00000413497 CPVLQ9H3G5 476 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 RAD50Q92878 1312 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 KDM4AO75164 1064 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 CYP2C9P11712 490 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 NCOR1O75376 2440 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 TRANK1O15050 2925 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD54-205ENST00000413497 A6NJR5 290 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 NUCB1Q02818 461 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 COPS5Q92905 334 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 VWCEQ96DN2 955 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 KAT14Q9H8E8 782 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 KPNA6O60684 536 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 IGHDP01880 384 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ANKS1AQ92625 1134 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 MAF1Q9H063 256 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ABCB11O95342 1321 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 B4E1Z4 1266 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 HIP1O00291 1037 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PFKMP08237 780 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 TTLL4Q14679 1199 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ZBBXA8MT70 800 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ARIH2O95376 493 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ADGRE1Q14246 886 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PPM1EQ8WY54 764 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 TBC1D5Q92609 795 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PTPRSQ13332 1948 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 REV3LO60673 3130 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 RABGGTBP53611 331 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-205ENST00000413497 PITPNM1O00562 1244 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 IGFBP4P22692 258 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 KRT23Q9C075 422 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 COL20A1Q9P218 1284 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 MYOGP15173 224 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 RFC2P35250 354 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 FBXO11Q86XK2 927 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 RETREG2Q8NC44 543 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 IWS1Q96ST2 819 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 RMDN3Q96TC7 470 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 GH1P01241 217 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 ACTN1P12814 892 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 STXBP2Q15833 593 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 LY6KQ17RY6 165 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 AFG1LQ8WV93 481 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 NOD1Q9Y239 953 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 MMP3P08254 477 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 IQCF3P0C7M6 154 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 CHMP4BP1P59074 171 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 ARHGAP1Q07960 439 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 BFSP2Q13515 415 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 THEGQ9P2T0 379 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-205ENST00000413497 MUC3AQ02505 3323 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms