RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIZQ2M2Z5 673 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM177Q53S58 311 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 KSR1Q8IVT5 923 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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RNU6-272P-201ENST00000411028 TCTN2Q96GX1 697 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCYL1Q96KG9 808 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 NACC1Q96RE7 527 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 EMC7Q9NPA0 242 aa5.75□□□□□ -1.49
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RNU6-272P-201ENST00000411028 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
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RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM87AP0C7U9 286 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCP1P13796 627 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNK2Q07912 1038 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 MLC1Q15049 377 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFKBIBQ15653 356 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCE2CQ5TA81 110 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 C11orf74Q86VG3 221 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 PANK1Q8TE04 598 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXW5Q969U6 566 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC1BQ9P126 229 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 PAMP19021 973 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SESN3P58005 492 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT85P78386 507 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADGRE1Q14246 886 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 RTP2Q5QGT7 225 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 MFSD4AQ8N468 514 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC66A2RUB6 948 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR33A8MZF0 331 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOD2P04179 222 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPN21Q16825 1174 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 BEND4Q6ZU67 534 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 USHBP1Q8N6Y0 703 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 GATA6Q92908 595 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC39A13Q96H72 371 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 IPPKQ9H8X2 491 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FZD9O00144 591 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 GSTM1P09488 218 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYBL2P10244 700 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNM2P50570 870 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
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