RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394998.5

STX4-202, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene STX4, Length 1,498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-202ENST00000394998 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 PXMP2Q9NR77 195 aa25.24■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 TMEM260Q9NX78 707 aa25.24■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 MMP1P03956 469 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 ELNP15502 786 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 MORC4Q8TE76 937 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 TRIB2Q92519 343 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 TINF2Q9BSI4 451 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.23■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 ASB14A6NK59 587 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 GUCY1B3Q02153 619 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 AP3B2Q13367 1082 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 OXER1Q8TDS5 423 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 RPTORQ8N122 1335 aa25.22■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 EDNRBP24530 442 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 MCTP2Q6DN12 878 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 IWS1Q96ST2 819 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 GRK4P32298 578 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
STX4-202ENST00000394998 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 NR3C2P08235 984 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CYP2C19P33261 490 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 KRT2P35908 639 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 ARMCX2Q7L311 632 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PGBD1Q96JS3 809 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 ANO3Q9BYT9 981 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 LCTP09848 1927 aa25.2■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 BTBD18B2RXH4 712 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 B4DLN1 442 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 HMGCRP04035 888 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PGM5Q15124 567 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 IL31RAQ8NI17 732 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 TNFRSF25Q93038 417 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.19■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PDCP20941 246 aa25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 UBXN2AP68543 259 aa25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 TRIM32Q13049 653 aa25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 NR5A1Q13285 461 aa25.17■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.17■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 H3BQV1 296 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 SYT1P21579 422 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 SREBF1P36956 1147 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PDE4DQ08499 809 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 IFFO2Q5TF58 517 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 KATNBL1Q9H079 304 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 HTTP42858 3142 aa25.16■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 INHAP05111 366 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CCND2P30279 289 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 STXBP2Q15833 593 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 ARHGAP4P98171 946 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.15■■□□□ 1.62
STX4-202ENST00000394998 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.14■■□□□ 1.61
STX4-202ENST00000394998 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
STX4-202ENST00000394998 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
STX4-202ENST00000394998 ACVR2BQ13705 512 aa25.14■■□□□ 1.61
STX4-202ENST00000394998 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms