RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 RBSNQ9H1K0 784 aa22.99■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 PANK2Q9BZ23 570 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 RIPK3Q9Y572 518 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 MRE11P49959 708 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TYRO3Q06418 890 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 HAS1Q92839 578 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.98■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 Q4G0T1 1027 aa22.97■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.97■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 COL20A1Q9P218 1284 aa22.97■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.97■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.97■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 FAM86B1E9PN63 330 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 CDC25AP30304 524 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TECP42680 631 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TXKP42681 527 aa22.96■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 LENG9Q96B70 501 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 RNF146Q9NTX7 359 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 PP2D1A8MPX8 630 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TXLNAP40222 546 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 LBX2Q6XYB7 198 aa22.96■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 DHX58Q96C10 678 aa22.96■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 RPTORQ8N122 1335 aa22.95■■□□□ 1.27
HDDC3-202ENST00000394272 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.95■■□□□ 1.27
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HDDC3-202ENST00000394272 PRR16Q569H4 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 MB21D1Q8N884 522 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 PNOCQ13519 176 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 DISC1Q9NRI5 854 aa22.93■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.93■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 CABP7Q86V35 215 aa22.92■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 MAF1Q9H063 256 aa22.92■■□□□ 1.26
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF76P36508 570 aa22.91■■□□□ 1.26
HDDC3-202ENST00000394272 HERVK_113P62684 666 aa22.91■■□□□ 1.26
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