RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 KAT2BQ92831 832 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 B4E1Z4 1266 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 KDM4AO75164 1064 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CPT1AP50416 773 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGAP1Q07960 439 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TCTN1Q2MV58 587 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 TICAM2Q86XR7 235 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PNMA1Q8ND90 353 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 DNERQ8NFT8 737 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 SCFD2Q8WU76 684 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 ANKS1AQ92625 1134 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.59■□□□□ 0.09
CNGA3-202ENST00000393503 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZBBXA8MT70 800 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 IQCF3P0C7M6 154 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 IGFBP4P22692 258 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NUCB1Q02818 461 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 LY6KQ17RY6 165 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KRT40Q6A162 431 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DGKHQ86XP1 1220 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RGS22Q8NE09 1264 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 AFG1LQ8WV93 481 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.58■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PTPRSQ13332 1948 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CA3P07451 260 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ESR2Q92731 530 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ASB2Q96Q27 587 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CERS4Q9HA82 394 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 THEGQ9P2T0 379 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MMP3P08254 477 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TFF2Q03403 129 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 HIC1Q14526 733 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 WNT8BQ93098 351 aa15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PITPNM1O00562 1244 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF213O14771 459 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RGS20O76081 388 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SENP2Q9HC62 589 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ABCB11O95342 1321 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 LCHNA4D1U4 455 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TNFRSF10AO00220 468 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PFKMP08237 780 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CHMP4BP1P59074 171 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TAP1Q03518 808 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SEC23AQ15436 765 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CHST3Q7LGC8 479 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 IL31RAQ8NI17 732 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MTMR8Q96EF0 704 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 RMDN3Q96TC7 470 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PNMA2Q9UL42 364 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-202ENST00000393503 KPNA6O60684 536 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms