RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 TTLL1O95922 423 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SEMA3FQ13275 785 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 LRRC41Q15345 812 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.19■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 TUBB2AQ13885 445 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 AMPD2Q01433 879 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC96Q2M329 555 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF543Q08ER8 600 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ECM1Q16610 540 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CENPPQ6IPU0 288 aa20.18■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L10C9JJH3 530 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MARCH6O60337 910 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZBED6P86452 979 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 BRD3Q15059 726 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MEA1Q16626 185 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 NUP58Q9BVL2 599 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SNHG28P0DPA3 235 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT79Q5XKE5 535 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.17■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 UNC13DQ70J99 1090 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 DDX12PQ92771 950 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MYH1P12882 1939 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SHMT1P34896 483 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT83P78385 493 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 NFIAQ12857 509 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SP8Q8IXZ3 490 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 COA1Q9GZY4 146 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCB6Q9NP58 842 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM196BA6NMK8 535 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 EPHB6O15197 1021 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.16■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 VSNL1P62760 191 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RAD54LQ92698 747 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RAB34Q9BZG1 259 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 STK17AQ9UEE5 414 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CACNB3P54284 484 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 GYS2P54840 703 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RETREG2Q8NC44 543 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 NDST4Q9H3R1 872 aa20.15■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 PSMD14O00487 310 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 PDIA5Q14554 519 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 VWA3BQ502W6 1294 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 HAS1Q92839 578 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 RAB21Q9UL25 225 aa20.14■□□□□ 0.82
UBQLN4-201ENST00000368309 KRT86O43790 486 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM37O94972 964 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 PPP1R2P41236 205 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 LY75O60449 1722 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L15C9J2P7 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L11C9JVI0 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L18D6R9N7 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L22D6RA61 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L19D6RCP7 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 USP17L20D6RJB6 530 aa20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4-201ENST00000368309 G3V3G9 751 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms