RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH12Q6ZR08 3092 aa17.26■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2MP0CAP2 368 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CST5P28325 142 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ADD1P35611 737 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RCAN1P53805 252 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 BEX3Q00994 111 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TRAF1Q13077 416 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 KCNA10Q16322 511 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TLK2Q86UE8 772 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NID2Q14112 1375 aa17.25■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CEP290O15078 2479 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PQY0 241 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ARIH2O95376 493 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IQSEC1Q6DN90 963 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD3Q8N6K7 520 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IL31RAQ8NI17 732 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.24■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NR3C2P08235 984 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ACLYP53396 1101 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RTP1P59025 263 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NKX3-2P78367 333 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 WWC2Q6AWC2 1192 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TYW1BQ6NUM6 668 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 USP17L6PQ6QN14 398 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 COPS5Q92905 334 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IWS1Q96ST2 819 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SPC25Q9HBM1 224 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.23■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 B4DLN1 442 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MEIS2O14770 477 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ASGR1P07306 291 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SYN1P17600 705 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 EVCP57679 992 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SNX17Q15036 470 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PGM5Q15124 567 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R5BQ15173 497 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 STXBP2Q15833 593 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf34Q49A92 452 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GNASQ5JWF2 1037 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SEPT14Q6ZU15 432 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 V9GY48 417 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MOXD2PA6NHM9 499 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PPFIA3O75145 1194 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CCT2P78371 535 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2SQ16763 222 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM60Q495X7 471 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SCFD2Q8WU76 684 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 AP5M1Q9H0R1 490 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 Q9Y3F1 56 aa17.21■□□□□ 0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.21■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 RGS20O76081 388 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TXNP10599 105 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 ANAPC15P60006 121 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NTRK3Q16288 839 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 LY6KQ17RY6 165 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 OR6J1Q8NGC5 347 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 STARD7Q9NQZ5 370 aa17.2■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 STXBP3O00186 592 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3CDO00329 1044 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 NAPAP54920 295 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL4Q14679 1199 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf53Q5VUE5 145 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 CUL5Q93034 780 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PHKBQ93100 1093 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 IL17RAQ96F46 866 aa17.19■□□□□ 0.34
CSAG1-201ENST00000361211 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms