RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa25.27■■□□□ 1.64
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C9orf163-201ENST00000354376 SPAG1Q07617 926 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 CLRN2A0PK11 232 aa25.26■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 KLRC3Q07444 240 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 USH1GQ495M9 461 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 SV2BQ7L1I2 683 aa25.26■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.25■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.25■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 NYAP2Q9P242 653 aa25.25■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 TTC26A0AVF1 554 aa25.24■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.24■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.23■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 THAP9Q9H5L6 903 aa25.23■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 ECE1P42892 770 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 KRT79Q5XKE5 535 aa25.22■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.21■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 EPC1Q9H2F5 836 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.21■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 ANO3Q9BYT9 981 aa25.21■■□□□ 1.63
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.21■■□□□ 1.63
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C9orf163-201ENST00000354376 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.19■■□□□ 1.62
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C9orf163-201ENST00000354376 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
C9orf163-201ENST00000354376 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.19■■□□□ 1.62
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