RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 LSP1P33241 339 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC24CP53992 1094 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUCY2DQ02846 1103 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 IQCKQ8N0W5 287 aa24.73■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP58Q5T655 872 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CABP7Q86V35 215 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 H0YHG0 523 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 NDST4Q9H3R1 872 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 FLT1P17948 1338 aa24.72■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 M0R2N6 131 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYL1P05976 194 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC1A4P43007 532 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUBCNQ92622 972 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY2A6NKD2 308 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 VWA3BQ502W6 1294 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAA35Q5VZE5 725 aa24.71■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0754O94854 1291 aa24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 EVA1CP58658 441 aa24.7■■□□□ 1.55
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 LCA5LO95447 670 aa24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.7■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFT20Q8IY31 132 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 GDF3Q9NR23 364 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPN3Q9H201 632 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFRSF8P28908 595 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CACNA1SQ13698 1873 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ORC4O43929 436 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 FTCDO95954 541 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 BAP1Q92560 729 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR1D1P20393 614 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF5BP33176 963 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOX5Q96PH1 765 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT12Q99456 494 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.68■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL4A1P02462 1669 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TECP42680 631 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 LETM2Q2VYF4 491 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CABS1Q96KC9 395 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CPVLQ9H3G5 476 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.67■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PJA2O43164 708 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 FSBPO95073 299 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTGISQ16647 500 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYTH3O43739 400 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R37O75864 691 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPPQ6IPU0 288 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD248Q9HCU0 757 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.66■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PALMO75781 387 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAP2K2P36507 400 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP8P40818 1118 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HGSNATQ68CP4 663 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA1Q8ND90 353 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 HPDP32754 393 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFT88Q13099 833 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYMQ7RTS9 669 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRP14Q86W24 1093 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 CENPHQ9H3R5 247 aa24.65■■□□□ 1.54
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms