RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CLIC2O15247 247 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 XKR9Q5GH70 373 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIM4Q9C037 500 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.83□□□□□ -0.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 GDAQ9Y2T3 454 aa14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 CUEDC2Q9H467 287 aa14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 LMNB1P20700 586 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 DEPTORQ8TB45 409 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.83□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 KRT81Q14533 505 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPS6KA2Q15349 733 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HSPA2P54652 639 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TBCKQ8TEA7 893 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 AZI2Q9H6S1 392 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 GPR108Q9NPR9 543 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMOD1P28289 359 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TAF12Q16514 161 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 RNF14Q9UBS8 474 aa14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PLCG1P19174 1290 aa14.81□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 EMBQ6PCB8 327 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 MB21D1Q8N884 522 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 STAM2O75886 525 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 GGCXP38435 758 aa14.8□□□□□ -0.04
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MCTP2Q6DN12 878 aa14.8□□□□□ -0.04
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