RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 KPNA6O60684 536 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGEF15O94989 841 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 TAP1Q03518 808 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ALX1Q15699 326 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 PNMA2Q9UL42 364 aa22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 PDHBP11177 359 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 KRT40Q6A162 431 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 RETREG2Q8NC44 543 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 DNERQ8NFT8 737 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 COPS5Q92905 334 aa22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 BFSP2Q13515 415 aa22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 TOMM22Q9NS69 142 aa22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 COG5Q9UP83 839 aa22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 TET1Q8NFU7 2136 aa22.36■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 BAIAP3O94812 1187 aa22.35■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.35■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 KIF28PB7ZC32 967 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ARIH2O95376 493 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 SNHG28P0DPA3 235 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF543Q08ER8 600 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 NOD1Q9Y239 953 aa22.34■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 ZMYM6O95789 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 FGAP02671 866 aa22.33■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 EVI5LQ96CN4 794 aa22.33■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 FAM122AQ96E09 287 aa22.33■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.33■■□□□ 1.17
SLX1A-201ENST00000251303 B4DLN1 442 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 TLL1O43897 1013 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 LPXNO60711 386 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 GRB10Q13322 594 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 PTGISQ16647 500 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 SPRED2Q7Z698 418 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 CAGE1Q8TC20 777 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 KCNJ6P48051 423 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 SESTD1Q86VW0 696 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 RGS22Q8NE09 1264 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 HLA-CQ95604 372 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 TTC14Q96N46 770 aa22.31■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 A0A0D9SFI3 127 aa22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 MMP3P08254 477 aa22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 GPNMBQ14956 572 aa22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 AFG1LQ8WV93 481 aa22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 FAM227BQ96M60 508 aa22.3■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 LCHNA4D1U4 455 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 CHMP4BP1P59074 171 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGAP1Q07960 439 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 RBL2Q08999 1139 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 USH1GQ495M9 461 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.29■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 SELPP16109 830 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 HAND2P61296 217 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 KAT2BQ92831 832 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 MAF1Q9H063 256 aa22.28■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 GH1P01241 217 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 DEFB103AP81534 67 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 LY6KQ17RY6 165 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.27■■□□□ 1.16
SLX1A-201ENST00000251303 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 CXCL10P02778 98 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 TICAM2Q86XR7 235 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 TBC1D5Q92609 795 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 CPVLQ9H3G5 476 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 COL20A1Q9P218 1284 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.26■■□□□ 1.15
SLX1A-201ENST00000251303 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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