RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PPFIA3O75145 1194 aa25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 PTGS1P23219 599 aa25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.7■■□□□ 1.71
SYF2-201ENST00000236273 STXBP3O00186 592 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS4O75173 837 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 COL6A1P12109 1028 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SCRN1Q12765 414 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 STK3Q13188 491 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 IWS1Q96ST2 819 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PFKFB2O60825 505 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 RARBP10826 455 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SMPD1P17405 629 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PDE4DQ08499 809 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 LRRC41Q15345 812 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 IL31RAQ8NI17 732 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 BARHL2Q9NY43 387 aa25.68■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE5O15320 804 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 LARGE1O95461 756 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PGK1P00558 417 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 NR3C2P08235 984 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD1Q15327 319 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 IQSEC1Q6DN90 963 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.67■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SCG2P13521 617 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP2Q03169 654 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PGM5Q15124 567 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ME3Q16798 604 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 BACH2Q9BYV9 841 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.66■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 MYADML2A6NDP7 307 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 DNM1LO00429 736 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 RGS20O76081 388 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 NKX3-2P78367 333 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.65■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 B4DLN1 442 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS3O15072 1205 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 CTDNEP1O95476 244 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 NAPAP54920 295 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 GJA9P57773 515 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 STXBP2Q15833 593 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 UBE2SQ16763 222 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-201ENST00000236273 DTNBO60941 627 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ARIH2O95376 493 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ALPK3Q96L96 1907 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SMCO2A6NFE2 343 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ST3GAL1Q11201 340 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 NECAB1Q8N987 351 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CUL5Q93034 780 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 Q9Y3F1 56 aa25.62■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CPLX1O14810 134 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 RNF180Q86T96 592 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 SCFD2Q8WU76 684 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 COPS5Q92905 334 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms