RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kremen1Q99N43 473 aa23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn7Q8R4I1 867 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap4B1AUY3 965 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Flvcr1B2RXV4 560 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcb4P21440 1276 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc25aP48964 514 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsr1Q5SWD9 803 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stxbp3Q60770 592 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q66JV7 365 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smc1bQ920F6 1248 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Setd4P58467 439 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sema4bQ62179 823 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctdp1Q7TSG2 960 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Maip1Q8BHE8 291 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bicdl2Q8CHW5 507 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd2Q8VDM4 908 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FignQ9ERZ6 759 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ercc4Q9QZD4 917 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm45208A0A140LJ36 292 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7168A0AUV4 508 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PurbO35295 324 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd14O35593 310 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RaraP11416 462 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtgdrP70263 357 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apba2P98084 750 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf280dQ68FE8 974 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk17Q8K0D0 523 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AacsQ9D2R0 672 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5737A0A140LI11 423 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube3aO08759 870 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nedd1P33215 660 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Armc6Q8BNU0 468 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IarsQ8BU30 1262 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 March8Q9DBD2 286 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myh14Q6URW6 2000 aa23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm1993A6X8I0 212 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SlxD3Z347 212 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sept2P42208 361 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mybl2P48972 704 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Qrich1Q3UA37 777 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akap4Q60662 849 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PodnQ7TQ62 611 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddah1Q9CWS0 285 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tjap1Q9DCD5 539 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pth1rP41593 591 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2e1Q05421 493 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thap3Q8BJ25 218 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hirip3Q8BLH7 601 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf131Q8K3J5 619 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grin3bQ91ZU9 1003 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dbndd2Q9CRD4 158 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc105Q9D4K7 499 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp597E9Q6S0 419 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map9Q3TRR0 646 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmtc1Q3UV71 942 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jakmip3Q5DTN8 844 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc10a5Q5PT54 434 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc9b1Q8C0X2 565 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sash3Q8K352 380 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndst4Q9EQW8 872 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifnar1P33896 590 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ItpripQ3TNL8 555 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eme2Q56A04 373 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc42Q5SV66 316 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brip1Q5SXJ3 1174 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Riox2Q8CD15 465 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces1Q8VCC2 565 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Card14Q99KF0 999 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smtnl1Q99LM3 459 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itgb4A2A863 1818 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4985A2ALC6 410 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Copb2O55029 905 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tigd5Q499M4 642 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phc3Q8CHP6 981 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Saal1Q9D2C2 474 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lonp2Q9DBN5 852 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mkrn1Q9QXP6 481 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vav3Q9R0C8 847 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ArcQ9WV31 396 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GabreA2AMW3 916 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms