RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035565.4

Pkd1-201, Transcript of Polycystin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkd1, Length 14,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1-201ENSMUST00000035565 NinQ61043 2035 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Gas7Q60780 421 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ahi1Q8K3E5 1047 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Eif6O55135 245 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Snx2Q9CWK8 519 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Mei4Q8BRM6 389 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Rbm41Q8JZV4 413 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Farp2Q91VS8 1065 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Naa16Q9DBB4 864 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Tac1P41539 130 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Oxr1Q4KMM3 866 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 GlyctkQ8QZY2 523 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Gm7535F7CXE4 302 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 S100a9P31725 113 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Zbtb45Q52KG4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Wdr27Q8C5V5 780 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Hacd3Q8K2C9 362 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sdr42e1Q9D665 394 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cdcp1Q5U462 833 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ccdc15Q8C9M2 810 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Nod2Q8K3Z0 1020 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Rabgef1Q9JM13 491 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 CiitaP79621 1155 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Wdr47Q8CGF6 920 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Znf467Q8JZL0 594 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 4933406M09RikG3XA12 479 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sycp3P70281 254 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Q3TTJ4 293 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ppp1r13bQ62415 1087 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sh3gl1Q62419 368 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Phactr3Q8BYK5 558 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Serpinb6cW4VSP4 379 aa9.6□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Smarca2Q6DIC0 1577 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Serpina3iD3Z450 408 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Prl7a2O54831 253 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Tmem232Q5K6N0 675 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Kdm5dQ62240 1548 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Speer4eK7N6S8 255 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Rnaseh1O70338 285 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Trip10Q8CJ53 603 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Top3aO70157 1003 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Mdh1P14152 334 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 HnmtQ91VF2 295 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 CinpQ9D0V8 212 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ext2P70428 718 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Nek8Q91ZR4 698 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cul3Q9JLV5 768 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Drp2Q05AA6 957 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Q6PD19 689 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Crlf3Q9Z2L7 442 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Gm28360A0A087WR25 190 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Creb3l3Q91XE9 479 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 PawrQ925B0 333 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 TnksQ6PFX9 1320 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Dynlt1P51807 113 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Nrbp1Q99J45 535 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Fads3Q9JJE7 449 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Lrrc43Q3V0L5 667 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 CpQ61147 1061 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Dhx37Q6NZL1 1150 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 3830403N18RikQ9D6C3 208 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Zfp558E9Q1J0 407 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ccdc185Q3V118 621 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Stambpl1Q76N33 436 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Taf11Q99JX1 211 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Fyb2A2A995 729 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Taf1bP97358 586 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Atp11aP98197 1187 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Tpcn2Q8BWC0 731 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Psma8Q9CWH6 250 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Ccdc130Q9D516 385 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Copb1Q9JIF7 953 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cyp2ab1S4R196 498 aa9.59□□□□□ -0.87
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sesn2P58043 480 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Fra10ac1Q8BP78 315 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Cpb1B2RS76 415 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Maml3D4QGC2 1135 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Sipa1P46062 1037 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 GnptabQ69ZN6 1235 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Fbxl5Q8C2S5 690 aa9.58□□□□□ -0.88
Pkd1-201ENSMUST00000035565 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms