RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-JR2P47099 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-DR1Q03856 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-BRQ12217 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-NL2Q12470 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-GR2Q12485 440 aa7.3□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A SEC2P17065 759 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A LAM6Q08001 693 aa7.29□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A TFB4Q12004 338 aa7.28□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YMR001C-AYMR001C-A PBS2P08018 668 aa7.25□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A GCR2Q01722 534 aa7.24□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A CKB1P43639 278 aa7.23□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A RGR1P19263 1082 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A YPR109WQ06104 294 aa7.22□□□□□ -1.25
YMR001C-AYMR001C-A GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.21□□□□□ -1.26not detected
YMR001C-AYMR001C-A MET22P32179 357 aa7.21□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A CDC4P07834 779 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A SPT16P32558 1035 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A BDP1P46678 594 aa7.19□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A NPL4P33755 580 aa7.18□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A RRN7P40992 514 aa7.15□□□□□ -1.26
YMR001C-AYMR001C-A MAM3Q12296 706 aa7.14□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A ENV9Q08651 330 aa7.13□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A ERF2Q06551 359 aa7.12□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A IES2P40154 320 aa7.11□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A KEX2P13134 814 aa7.1□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A DSF2P38213 736 aa7.1□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A HED1Q03937 162 aa7.09□□□□□ -1.27
YMR001C-AYMR001C-A YDL176WQ12027 708 aa7.08□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A YDR444WQ04093 687 aa7.07□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A MET32Q12041 191 aa7.06□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A DIT2P21595 489 aa7.04□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A ASH1P34233 588 aa7.03□□□□□ -1.28
YMR001C-AYMR001C-A PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A MOD5P07884 428 aa7.01□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A PAT1P25644 796 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A CLB5P30283 435 aa6.99□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A TEA1P47988 759 aa6.99□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A PUS5Q06244 254 aa6.99□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A AFT1P22149 690 aa6.97□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A TUB4P53378 473 aa6.97□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A NIS1P53939 407 aa6.97□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A AGE1Q04412 482 aa6.97□□□□□ -1.29
YMR001C-AYMR001C-A RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A YNL115CP53925 644 aa6.94□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A SIT4P20604 311 aa6.93□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A YJR115WP47152 169 aa6.92□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A RTF1P53064 558 aa6.92□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A HST3P53687 447 aa6.91□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A FPK1P53739 893 aa6.9□□□□□ -1.3
YMR001C-AYMR001C-A SLY41P22215 453 aa6.87□□□□□ -1.31
YMR001C-AYMR001C-A SCJ1P25303 377 aa6.87□□□□□ -1.31
YMR001C-AYMR001C-A YMR196WQ04336 1088 aa6.87□□□□□ -1.31
YMR001C-AYMR001C-A GLC3P32775 704 aa6.83□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A ATF2P53296 535 aa6.83□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A CAF120P53836 1060 aa6.83□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A KXD1P53158 218 aa6.82□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A ACO2P39533 789 aa6.8□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A HXT10P43581 546 aa6.8□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A HST2P53686 357 aa6.79□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A MMP1Q12372 583 aa6.78□□□□□ -1.32
YMR001C-AYMR001C-A ESS1P22696 170 aa6.77□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A PUS6P53294 404 aa6.77□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A YDL206WQ12424 762 aa6.77□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A TBF1Q02457 562 aa6.76□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A MTC5Q03897 1148 aa6.76□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A OPT2Q06593 877 aa6.76□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A TPD3P31383 635 aa6.75□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A YJU3P28321 313 aa6.74□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A RPA14P50106 137 aa6.73□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A ALR1Q08269 859 aa6.73□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A YPR097WQ06839 1073 aa6.72□□□□□ -1.33
YMR001C-AYMR001C-A KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A TRK2P28584 889 aa6.71□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.71□□□□□ -1.34not detected
YMR001C-AYMR001C-A SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A KIP2P28743 706 aa6.69□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A UGA3P26370 528 aa6.68□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A YIR007WP40566 764 aa6.68□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A YGR035CP53222 116 aa6.66□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A HPF1Q05164 967 aa6.66□□□□□ -1.34
YMR001C-AYMR001C-A AIM7Q12156 149 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms