RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-JR2P47099 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-DR1Q03856 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-BRQ12217 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-NL2Q12470 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C TY1A-GR2Q12485 440 aa7.89□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C YPR109WQ06104 294 aa7.88□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C CLA4P48562 842 aa7.87□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C RGR1P19263 1082 aa7.85□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C BRE2P43132 505 aa7.84□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C LAM6Q08001 693 aa7.84□□□□□ -1.15
YKL115CYKL115C RRN7P40992 514 aa7.83□□□□□ -1.16
YKL115CYKL115C GCR2Q01722 534 aa7.82□□□□□ -1.16
YKL115CYKL115C PAT1P25644 796 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YKL115CYKL115C BDP1P46678 594 aa7.79□□□□□ -1.16
YKL115CYKL115C YPL062WQ02781 134 aa7.77□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C KEX2P13134 814 aa7.76□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C CDC4P07834 779 aa7.75□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C PBS2P08018 668 aa7.74□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C ERF2Q06551 359 aa7.74□□□□□ -1.17
YKL115CYKL115C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.73□□□□□ -1.17not detected
YKL115CYKL115C CKB1P43639 278 aa7.71□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C HED1Q03937 162 aa7.71□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C PAC1P39946 494 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C DMA1P38823 416 aa7.66□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C CLB5P30283 435 aa7.65□□□□□ -1.18
YKL115CYKL115C MET22P32179 357 aa7.64□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C TUB4P53378 473 aa7.63□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C MAM3Q12296 706 aa7.63□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C MOD5P07884 428 aa7.62□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C AGE1Q04412 482 aa7.62□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C PUS5Q06244 254 aa7.61□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C ASH1P34233 588 aa7.6□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C ENV9Q08651 330 aa7.6□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C MET32Q12041 191 aa7.6□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C RTF1P53064 558 aa7.59□□□□□ -1.19
YKL115CYKL115C IES2P40154 320 aa7.58□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C HST3P53687 447 aa7.58□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C YNL115CP53925 644 aa7.58□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C YDR444WQ04093 687 aa7.57□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C AFT1P22149 690 aa7.56□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C TEA1P47988 759 aa7.55□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C DSF2P38213 736 aa7.54□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C SIT4P20604 311 aa7.53□□□□□ -1.2
YKL115CYKL115C KXD1P53158 218 aa7.52□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C NIS1P53939 407 aa7.51□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C HXT10P43581 546 aa7.47□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C YJR115WP47152 169 aa7.47□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
YKL115CYKL115C TPD3P31383 635 aa7.46□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C SLY41P22215 453 aa7.45□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C DIT2P21595 489 aa7.44□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C YMR196WQ04336 1088 aa7.44□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C FPK1P53739 893 aa7.43□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C YDL176WQ12027 708 aa7.43□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
YKL115CYKL115C TBF1Q02457 562 aa7.39□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C UGA3P26370 528 aa7.38□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C KIP2P28743 706 aa7.38□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C ALR1Q08269 859 aa7.38□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C PUS6P53294 404 aa7.37□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C YDL206WQ12424 762 aa7.37□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C RPA14P50106 137 aa7.36□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C SRF1Q12516 437 aa7.35□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C SCJ1P25303 377 aa7.34□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C YPR097WQ06839 1073 aa7.34□□□□□ -1.23
YKL115CYKL115C IXR1P33417 597 aa7.33□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C CAF120P53836 1060 aa7.31□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C OPT2Q06593 877 aa7.31□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C HST2P53686 357 aa7.3□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C YLR346CQ06139 101 aa7.3□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C MMP1Q12372 583 aa7.29□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C ACO2P39533 789 aa7.28□□□□□ -1.24
YKL115CYKL115C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.28□□□□□ -1.24not detected
YKL115CYKL115C MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C ATF2P53296 535 aa7.26□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C GLN1P32288 370 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C ESS1P22696 170 aa7.24□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C NUP85P46673 744 aa7.24□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C RTT106P40161 455 aa7.23□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YKL115CYKL115C MIP1P15801 1254 aa7.2□□□□□ -1.26
YKL115CYKL115C SCW11P53189 542 aa7.2□□□□□ -1.26
YKL115CYKL115C VAC17P25591 423 aa7.19□□□□□ -1.26
YKL115CYKL115C YJU3P28321 313 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms