RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeastyeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC3YJL059W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W DCW1P36091 449 aa9.15□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W TFB3Q03290 321 aa9.15□□□□□ -0.94
YHC3YJL059W SIN3P22579 1536 aa9.15□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W SSA4P22202 642 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W PAM1P37304 830 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W YEL023CP39992 682 aa9.14□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W YTA7P40340 1379 aa9.12□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W BCK2P33306 851 aa9.12□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W EDS1P38073 919 aa9.12□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W YPK9Q12697 1472 aa9.12□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W DNF2Q12675 1612 aa9.11□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W HEM3P28789 327 aa9.1□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W PRE3P38624 215 aa9.1□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W RRN6P32786 894 aa9.09□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W NUG1P40010 520 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W SUB1P54000 292 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W ESP1Q03018 1630 aa9.09□□□□□ -0.95
YHC3YJL059W SCC2Q04002 1493 aa9.08□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W SSA2P10592 639 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W DOS2P54858 310 aa9.06□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W YOR093CQ12275 1648 aa9.05□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W ASF1P32447 279 aa9.05□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W RTS3P53289 263 aa9.05□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W CDC3P32457 520 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W SPC42P36094 363 aa9.03□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W BIM1P40013 344 aa9.03□□□□□ -0.96
YHC3YJL059W YJL007CP47080 104 aa9.02□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W FAR11P53917 953 aa9.02□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W VPS15P22219 1454 aa9.02□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W PKC1P24583 1151 aa9.01□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W VPS72Q03388 795 aa9.01□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W TRM732Q03496 1420 aa9.01□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W TY1B-BRQ12193 1756 aa9□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W TY1B-GR3Q12316 1755 aa9□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W TY1B-ORQ92393 1755 aa9□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W CSN12P47130 423 aa8.99□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W GUT1P32190 709 aa8.98□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W ATH1P48016 1211 aa8.97□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W YDR090CQ03193 310 aa8.97□□□□□ -0.97
YHC3YJL059W OCA5P38738 679 aa8.96□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W VHR2P40041 505 aa8.95□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W ATG32P40458 529 aa8.95□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W PML39Q03760 334 aa8.95□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W SWE1P32944 819 aa8.94□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W ATG36P46983 293 aa8.94□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W KIC1P38692 1080 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W LAM6Q08001 693 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-FP0CX63 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-CP25384 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-DR2Q03494 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY1B-DR1Q03855 1755 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-OR1Q12113 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-DR1Q12472 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W TY2B-OR2Q12501 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W NUP159P40477 1460 aa8.92□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W CPS1P27614 576 aa8.92□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W YJR008WP47085 338 aa8.92□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W YAF9P53930 226 aa8.92□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W YRF1-1P0CX20 1796 aa8.91□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W YRF1-5P0CX21 1796 aa8.91□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W YRF1-8P0CX22 1796 aa8.91□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W XDJ1P39102 459 aa8.91□□□□□ -0.98
YHC3YJL059W MMS22Q06164 1454 aa8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W NNF1P47149 201 aa8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W HAT1Q12341 374 aa8.89□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W VRP1P37370 817 aa8.88□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W OSW7P43611 510 aa8.88□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W ARH1P48360 493 aa8.88□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W NST1P53935 1240 aa8.88□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W ALD4P46367 519 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W YDR344CQ05510 147 aa8.85□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W TTI1P36097 1038 aa8.84□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W TEA1P47988 759 aa8.84□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W YPR204WQ08995 1032 aa8.84□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W GIN4Q12263 1142 aa8.84□□□□□ -0.99
YHC3YJL059W AI4P03878 556 aa8.83□□□□□ -1
YHC3YJL059W ERG12P07277 443 aa8.83□□□□□ -1
YHC3YJL059W RAD54P32863 898 aa8.83□□□□□ -1
YHC3YJL059W YBL036CP38197 257 aa8.83□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-HO13535 1793 aa8.82□□□□□ -1
YHC3YJL059W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms