RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 HFM1A2PYH4 1435 aa10.83□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 GRIN2AQ12879 1464 aa10.83□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.82□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 KIF14Q15058 1648 aa10.8□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.79□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.79□□□□□ -0.68
PCAT5-201ENST00000626667 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.78□□□□□ -0.68
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PCAT5-201ENST00000626667 MIA2Q96PC5 1412 aa10.77□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.76□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 FMN1Q68DA7 1419 aa10.75□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.75□□□□□ -0.69
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PCAT5-201ENST00000626667 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.74□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.74□□□□□ -0.69
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PCAT5-201ENST00000626667 NAIPQ13075 1403 aa10.73□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.72□□□□□ -0.69
PCAT5-201ENST00000626667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.71□□□□□ -0.69
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PCAT5-201ENST00000626667 ROCK1Q13464 1354 aa10.7□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.7□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.7□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.7□□□□□ -0.7
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PCAT5-201ENST00000626667 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.67□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 KDM5CP41229 1560 aa10.67□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 CEP152O94986 1710 aa10.67□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.67□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.66□□□□□ -0.7
PCAT5-201ENST00000626667 PZPP20742 1482 aa10.66□□□□□ -0.7
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PCAT5-201ENST00000626667 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.64□□□□□ -0.71
PCAT5-201ENST00000626667 IQGAP1P46940 1657 aa10.64□□□□□ -0.71
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PCAT5-201ENST00000626667 TTC37Q6PGP7 1564 aa10.63□□□□□ -0.71
PCAT5-201ENST00000626667 UACAQ9BZF9 1416 aa10.63□□□□□ -0.71
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PCAT5-201ENST00000626667 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
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PCAT5-201ENST00000626667 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.56□□□□□ -0.72
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PCAT5-201ENST00000626667 ABCC5O15440 1437 aa10.56□□□□□ -0.72
PCAT5-201ENST00000626667 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.55□□□□□ -0.72
PCAT5-201ENST00000626667 DAPK1P53355 1430 aa10.55□□□□□ -0.72
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PCAT5-201ENST00000626667 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.53□□□□□ -0.72
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PCAT5-201ENST00000626667 ATP10BO94823 1461 aa10.51□□□□□ -0.73
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PCAT5-201ENST00000626667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.5□□□□□ -0.73
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PCAT5-201ENST00000626667 MADDQ8WXG6 1647 aa10.49□□□□□ -0.73
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PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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PCAT5-201ENST00000626667 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.47□□□□□ -0.73
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PCAT5-201ENST00000626667 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.45□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.45□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 USP32Q8NFA0 1604 aa10.45□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.44□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 NCOA1Q15788 1441 aa10.44□□□□□ -0.74
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PCAT5-201ENST00000626667 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PCAT5-201ENST00000626667 PPLO60437 1756 aa10.43□□□□□ -0.74
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