RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.83■□□□□ 0.6
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C9orf170-201ENST00000623052 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.8■□□□□ 0.6
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C9orf170-201ENST00000623052 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf170-201ENST00000623052 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.57■□□□□ 0.56
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C9orf170-201ENST00000623052 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.47■□□□□ 0.55
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C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.44■□□□□ 0.54
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.44■□□□□ 0.54
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C9orf170-201ENST00000623052 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.37■□□□□ 0.53
C9orf170-201ENST00000623052 SHROOM2Q13796 1616 aa18.36■□□□□ 0.53
C9orf170-201ENST00000623052 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.35■□□□□ 0.53
C9orf170-201ENST00000623052 UNC13BO14795 1591 aa18.34■□□□□ 0.53
C9orf170-201ENST00000623052 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.33■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.33■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.33■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.32■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 TSPY4P0CV99 314 aa18.3■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 TSPY10P0CW01 314 aa18.3■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2R1Q13018 1463 aa18.29■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.29■□□□□ 0.52
C9orf170-201ENST00000623052 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.28■□□□□ 0.52
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