RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 PLIN1O60240 522 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 RALBP1Q15311 655 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.83■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 NLRP13Q86W25 1043 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 MORC1Q86VD1 984 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 PDE4AP27815 886 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 C14orf37Q86TY3 774 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 PLCB2Q00722 1185 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 HSCBQ8IWL3 235 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 POGKQ9P215 609 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA2Q08379 1002 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 APBB1O00213 710 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SMARCA4P51532 1647 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SMARCA2P51531 1590 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 CASC1Q6TDU7 716 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRT-210ENST00000617474 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 SOX12O15370 315 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MS4A1P11836 297 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 CRBNQ96SW2 442 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 KIF21BO75037 1637 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 PDE3BQ13370 1112 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 PANK3Q9H999 370 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 STK26Q9P289 416 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 USP47Q96K76 1375 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRT-210ENST00000617474 GGT6Q6P531 493 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 KIF15Q9NS87 1388 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ARID3AQ99856 593 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 IGF1RP08069 1367 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC7Q96M83 1385 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC184Q52MB2 194 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 GSE1Q14687 1217 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRT-210ENST00000617474 ARAP1Q96P48 1450 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 FAM161AQ3B820 660 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 USP35Q9P2H5 1018 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 COG6Q9Y2V7 657 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 APAF1O14727 1248 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 A0A0G2JS52 829 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.54■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 ERCC6Q03468 1493 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 KANK1Q14678 1352 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 GBP4Q96PP9 640 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
PTPRT-210ENST00000617474 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.52■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 KIF3BO15066 747 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 KCNJ4P48050 445 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 UACAQ9BZF9 1416 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 MLECQ14165 292 aa19.48■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.47■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PTPRT-210ENST00000617474 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.7 ms