RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
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HDGFL2-208ENST00000616600 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.67■■■□□ 2.18
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HDGFL2-208ENST00000616600 CHD1O14646 1710 aa28.59■■■□□ 2.17
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HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.57■■■□□ 2.16
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HDGFL2-208ENST00000616600 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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HDGFL2-208ENST00000616600 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.52■■■□□ 2.16
HDGFL2-208ENST00000616600 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.51■■■□□ 2.16
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HDGFL2-208ENST00000616600 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.49■■■□□ 2.15
HDGFL2-208ENST00000616600 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.154e-8■■■■■ 52.9
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HDGFL2-208ENST00000616600 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.47■■■□□ 2.15
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HDGFL2-208ENST00000616600 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.45■■■□□ 2.14
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HDGFL2-208ENST00000616600 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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HDGFL2-208ENST00000616600 KDM5CP41229 1560 aa28.04■■■□□ 2.08
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