RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575237.2

CREBBP-211, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CREBBP, Length 403 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-211ENST00000575237 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 PLCH2O75038 1416 aa23.75■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 ATP10AO60312 1499 aa23.75■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.73■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 ILDR2Q71H61 639 aa23.73■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.73■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 SOCS7O14512 581 aa23.71■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.71■■□□□ 1.39
CREBBP-211ENST00000575237 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CREBBP-211ENST00000575237 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CREBBP-211ENST00000575237 EEA1Q15075 1411 aa23.67■■□□□ 1.38
CREBBP-211ENST00000575237 STRCQ7RTU9 1775 aa23.67■■□□□ 1.38
CREBBP-211ENST00000575237 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.64■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.63■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.6■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 PTPRTO14522 1441 aa23.59■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.58■■□□□ 1.37
CREBBP-211ENST00000575237 KDM5CP41229 1560 aa23.57■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 AFAP1Q8N556 730 aa23.55■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.54■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 REREQ9P2R6 1566 aa23.54■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.52■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CREBBP-211ENST00000575237 KIF14Q15058 1648 aa23.51■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 FMN1Q68DA7 1419 aa23.5■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.5■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.49■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.49■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.48■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 C3P01024 1663 aa23.48■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 AGLP35573 1532 aa23.47■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CREBBP-211ENST00000575237 ABCA6Q8N139 1617 aa23.45■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 NCOA1Q15788 1441 aa23.44■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.44■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 CLIP1P30622 1438 aa23.42■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.41■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.4■■□□□ 1.34
CREBBP-211ENST00000575237 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.38■■□□□ 1.33
CREBBP-211ENST00000575237 ABCC1P33527 1531 aa23.37■■□□□ 1.33
CREBBP-211ENST00000575237 NPATQ14207 1427 aa23.34■■□□□ 1.33
CREBBP-211ENST00000575237 PREX2Q70Z35 1606 aa23.33■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.32■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.32■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.32■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.3■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 MROH2AA6NES4 1674 aa23.28■■□□□ 1.32
CREBBP-211ENST00000575237 ZMYM3Q14202 1370 aa23.27■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.26■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.25■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.24■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 PLA2R1Q13018 1463 aa23.24■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.23■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 PKD2Q13563 968 aa23.22■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.22■■□□□ 1.31
CREBBP-211ENST00000575237 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.2■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.19■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 PTPRKQ15262 1439 aa23.16■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.16■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.15■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 PLXNC1O60486 1568 aa23.14■■□□□ 1.3
CREBBP-211ENST00000575237 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 ATP7AQ04656 1500 aa23.12■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.11■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.11■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 A2MP01023 1474 aa23.11■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CREBBP-211ENST00000575237 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.05■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.05■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 HSPA1LP34931 641 aa23.05■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 GGT6Q6P531 493 aa23.05■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CREBBP-211ENST00000575237 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 CPS1P31327 1500 aa23.01■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 TOM1O60784 492 aa23■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 PIP4K2BP78356 416 aa22.98■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.97■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.97■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.97■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.97■■□□□ 1.27
CREBBP-211ENST00000575237 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CREBBP-211ENST00000575237 TNRQ92752 1358 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 261.2 ms