RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562648.2

FBXL16-205, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FBXL16, Length 2,531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL16-205ENST00000562648 ABCC5O15440 1437 aa41.71■■■■■ 4.27
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FBXL16-205ENST00000562648 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.66■■■■■ 4.26
FBXL16-205ENST00000562648 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
FBXL16-205ENST00000562648 SYNJ2O15056 1496 aa41.65■■■■■ 4.26
FBXL16-205ENST00000562648 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
FBXL16-205ENST00000562648 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.61■■■■■ 4.25
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FBXL16-205ENST00000562648 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
FBXL16-205ENST00000562648 ROCK1Q13464 1354 aa41.6■■■■■ 4.25
FBXL16-205ENST00000562648 BCANQ96GW7 911 aa41.59■■■■■ 4.25
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FBXL16-205ENST00000562648 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.53■■■■■ 4.24
FBXL16-205ENST00000562648 JPH4Q96JJ6 628 aa41.51■■■■■ 4.24
FBXL16-205ENST00000562648 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
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FBXL16-205ENST00000562648 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
FBXL16-205ENST00000562648 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
FBXL16-205ENST00000562648 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
FBXL16-205ENST00000562648 KIF14Q15058 1648 aa41.46■■■■■ 4.23
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FBXL16-205ENST00000562648 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.46■■■■■ 4.23
FBXL16-205ENST00000562648 NUP160Q12769 1436 aa41.46■■■■■ 4.23
FBXL16-205ENST00000562648 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
FBXL16-205ENST00000562648 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
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FBXL16-205ENST00000562648 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa41.34■■■■■ 4.21
FBXL16-205ENST00000562648 NCOA1Q15788 1441 aa41.33■■■■■ 4.21
FBXL16-205ENST00000562648 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.33■■■■■ 4.21
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FBXL16-205ENST00000562648 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.3■■■■■ 4.2
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FBXL16-205ENST00000562648 CCDC7Q96M83 1385 aa41.24■■■■■ 4.19
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FBXL16-205ENST00000562648 NEFLP07196 543 aa41.2■■■■■ 4.19
FBXL16-205ENST00000562648 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.18■■■■■ 4.18
FBXL16-205ENST00000562648 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.15■■■■■ 4.18
FBXL16-205ENST00000562648 ADGRL2O95490 1459 aa41.14■■■■■ 4.18
FBXL16-205ENST00000562648 ABCA8O94911 1581 aa41.13■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 ATP10BO94823 1461 aa41.13■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 PKD2Q13563 968 aa41.13■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.13■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.11■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.11■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 KIF7Q2M1P5 1343 aa41.1■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.09■■■■■ 4.17
FBXL16-205ENST00000562648 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
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FBXL16-205ENST00000562648 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.06■■■■■ 4.16
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FBXL16-205ENST00000562648 NUP155O75694 1391 aa40.95■■■■■ 4.15
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FBXL16-205ENST00000562648 MRS2Q9HD23 443 aa40.92■■■■■ 4.14
FBXL16-205ENST00000562648 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
FBXL16-205ENST00000562648 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
FBXL16-205ENST00000562648 POLR3GLQ9BT43 218 aa40.88■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 CHD1O14646 1710 aa40.88■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 USP47Q96K76 1375 aa40.87■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 TSPY4P0CV99 314 aa40.87■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 TSPY10P0CW01 314 aa40.87■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.85■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.85■■■■■ 4.13
FBXL16-205ENST00000562648 KIF15Q9NS87 1388 aa40.8■■■■■ 4.12
FBXL16-205ENST00000562648 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.74■■■■■ 4.11
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FBXL16-205ENST00000562648 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.7■■■■■ 4.11
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FBXL16-205ENST00000562648 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.65■■■■■ 4.1
FBXL16-205ENST00000562648 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.65■■■■■ 4.1
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FBXL16-205ENST00000562648 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.61■■■■■ 4.09
FBXL16-205ENST00000562648 ZBED9Q6R2W3 1325 aa40.61■■■■■ 4.09
FBXL16-205ENST00000562648 PREX2Q70Z35 1606 aa40.61■■■■■ 4.09
FBXL16-205ENST00000562648 SHROOM2Q13796 1616 aa40.59■■■■■ 4.09
FBXL16-205ENST00000562648 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
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FBXL16-205ENST00000562648 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.54■■■■■ 4.08
FBXL16-205ENST00000562648 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.54■■■■■ 4.08
FBXL16-205ENST00000562648 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
FBXL16-205ENST00000562648 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.53■■■■■ 4.08
FBXL16-205ENST00000562648 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.51■■■■■ 4.08
FBXL16-205ENST00000562648 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.48■■■■■ 4.07
FBXL16-205ENST00000562648 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.48■■■■■ 4.07
FBXL16-205ENST00000562648 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.07
FBXL16-205ENST00000562648 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
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