RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556765.1

TRAPPC6B-206, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC6B, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PTPRTO14522 1441 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6B-206ENST00000556765 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HECW1Q76N89 1606 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC6B-206ENST00000556765 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PRXQ9BXM0 1461 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SAMD9Q5K651 1589 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP10AO60312 1499 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6B-206ENST00000556765 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NCOA1Q15788 1441 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6B-206ENST00000556765 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLCH2O75038 1416 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC6B-206ENST00000556765 C3P01024 1663 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC6B-206ENST00000556765 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KDM5CP41229 1560 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 REREQ9P2R6 1566 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AFAP1Q8N556 730 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HSPA1LP34931 641 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 AGLP35573 1532 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ABCA6Q8N139 1617 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NPATQ14207 1427 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PIP4K2BP78356 416 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PKD2Q13563 968 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLA2R1Q13018 1463 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KIF14Q15058 1648 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MROH2AA6NES4 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TOM1O60784 492 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZMYM3Q14202 1370 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
TRAPPC6B-206ENST00000556765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CEP162Q5TB80 1403 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ABCC1P33527 1531 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CPS1P31327 1500 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CLIP1P30622 1438 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PTPRKQ15262 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 FMN1Q68DA7 1419 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PREX2Q70Z35 1606 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ALKQ9UM73 1620 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 PLXNC1O60486 1568 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 GGT6Q6P531 493 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 A2MP01023 1474 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ATP7AQ04656 1500 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6B-206ENST00000556765 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.14■■□□□ 1.14
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