RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554226.5

NEDD1-206, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-206ENST00000554226 PLCH2O75038 1416 aa23.44■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.43■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.41■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 MLECQ14165 292 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 ATP10AO60312 1499 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD1-206ENST00000554226 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-206ENST00000554226 ILDR2Q71H61 639 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-206ENST00000554226 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-206ENST00000554226 KDM5CP41229 1560 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-206ENST00000554226 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-206ENST00000554226 STRCQ7RTU9 1775 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 SOCS7O14512 581 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 REREQ9P2R6 1566 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 FMN1Q68DA7 1419 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 KIF14Q15058 1648 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-206ENST00000554226 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-206ENST00000554226 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-206ENST00000554226 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-206ENST00000554226 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-206ENST00000554226 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-206ENST00000554226 AGLP35573 1532 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 PTPRTO14522 1441 aa23.2■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 C3P01024 1663 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 ABCA6Q8N139 1617 aa23.19■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.18■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 CLIP1P30622 1438 aa23.16■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 PREX2Q70Z35 1606 aa23.15■■□□□ 1.3
NEDD1-206ENST00000554226 AFAP1Q8N556 730 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.14■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 ABCC1P33527 1531 aa23.13■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.12■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.11■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.09■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.08■■□□□ 1.29
NEDD1-206ENST00000554226 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.08■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 MROH2AA6NES4 1674 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 NCOA1Q15788 1441 aa23.06■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.04■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.03■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 NPATQ14207 1427 aa23.02■■□□□ 1.28
NEDD1-206ENST00000554226 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NEDD1-206ENST00000554226 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.99■■□□□ 1.27
NEDD1-206ENST00000554226 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
NEDD1-206ENST00000554226 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 PLXNC1O60486 1568 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 PLA2R1Q13018 1463 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
NEDD1-206ENST00000554226 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 ZMYM3Q14202 1370 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 ATP7AQ04656 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD1-206ENST00000554226 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 PTPRKQ15262 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 A2MP01023 1474 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 PKD2Q13563 968 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD1-206ENST00000554226 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-206ENST00000554226 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD1-206ENST00000554226 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-206ENST00000554226 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD1-206ENST00000554226 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD1-206ENST00000554226 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 MBD5Q9P267 1494 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 HSPA1LP34931 641 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 CPS1P31327 1500 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 TIAM1Q13009 1591 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-206ENST00000554226 GGT6Q6P531 493 aa22.65■■□□□ 1.22
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