RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.15□□□□□ -0.3
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 STRCQ7RTU9 1775 aa13.14□□□□□ -0.31
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa13.13□□□□□ -0.31
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.13□□□□□ -0.31
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.13□□□□□ -0.31
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRXQ9BXM0 1461 aa13.13□□□□□ -0.31
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HECW1Q76N89 1606 aa13.12□□□□□ -0.31
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.09□□□□□ -0.31
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SAMD9Q5K651 1589 aa13.03□□□□□ -0.32
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.97□□□□□ -0.33
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.93□□□□□ -0.34
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.92□□□□□ -0.34
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.9□□□□□ -0.34
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PLA2R1Q13018 1463 aa12.84□□□□□ -0.35
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIF14Q15058 1648 aa12.82□□□□□ -0.36
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PTPRKQ15262 1439 aa12.79□□□□□ -0.36
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.79□□□□□ -0.36
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.79□□□□□ -0.36
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ABCC1P33527 1531 aa12.75□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 EEA1Q15075 1411 aa12.75□□□□□ -0.37
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.75□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.74□□□□□ -0.37
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.74□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 POTEAQ6S8J7 498 aa12.73□□□□□ -0.37
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TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A2MP01023 1474 aa12.72□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TNRQ92752 1358 aa12.71□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.71□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.71□□□□□ -0.37
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.69□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PREX2Q70Z35 1606 aa12.68□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KIF3BO15066 747 aa12.67□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.66□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SYCP2Q9BX26 1530 aa12.66□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ALKQ9UM73 1620 aa12.66□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 VWDEQ8N2E2 1590 aa12.65□□□□□ -0.38
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NEURL4Q96JN8 1562 aa12.65□□□□□ -0.38
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