RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	PANK2	Q9BZ23	570 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		10.27	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	ESPN	B1AK53	854 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF21B	O75037	1637 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	TONSL	Q96HA7	1378 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	ERBB4	Q15303	1308 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		10.22	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP7D2	Q96T17	732 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	ARID3A	Q99856	593 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZNF438-208	ENST00000538351	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.19	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXD1	Q16676	465 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	RIPK4	P57078	832 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	MRE11	P49959	708 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	DMTN	Q08495	405 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM51	Q9NW97	253 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	NCOA2	Q15596	1464 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	PRDM2	Q13029	1718 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	OFD1	O75665	1012 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	CFTR	P13569	1480 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	TERF1	P54274	439 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	BECN1	Q14457	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ZNF438-208	ENST00000538351	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ARAP1	Q96P48	1450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF20A	O95235	890 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	UQCRH	P07919	91 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC7	Q96M83	1385 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	TRAK2	O60296	914 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	MCM4	P33991	863 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	PLIN1	O60240	522 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB22	O15209	634 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNF438-208	ENST00000538351	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	NCOA1	Q15788	1441 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNF438-208	ENST00000538351	TMC1	Q8TDI8	760 aa		10	□□□□□ -0.81

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