RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526815.5

BBS1-211, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 3

Gene BBS1, Length 584 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-211ENST00000526815 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.12■□□□□ 0.97
BBS1-211ENST00000526815 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
BBS1-211ENST00000526815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.08■□□□□ 0.97
BBS1-211ENST00000526815 HECW1Q76N89 1606 aa21.07■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 P3H3Q8IVL6 736 aa21.04■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.04■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.02■□□□□ 0.96
BBS1-211ENST00000526815 ATP10AO60312 1499 aa21.01■□□□□ 0.95
BBS1-211ENST00000526815 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
BBS1-211ENST00000526815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
BBS1-211ENST00000526815 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
BBS1-211ENST00000526815 SAMD9Q5K651 1589 aa20.97■□□□□ 0.95
BBS1-211ENST00000526815 PRXQ9BXM0 1461 aa20.95■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.95■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 NCOA1Q15788 1441 aa20.95■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.95■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.94■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 C3P01024 1663 aa20.91■□□□□ 0.94
BBS1-211ENST00000526815 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.86■□□□□ 0.93
BBS1-211ENST00000526815 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
BBS1-211ENST00000526815 PLCH2O75038 1416 aa20.84■□□□□ 0.93
BBS1-211ENST00000526815 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.83■□□□□ 0.93
BBS1-211ENST00000526815 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.81■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 REREQ9P2R6 1566 aa20.8■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.8■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 HSPA1LP34931 641 aa20.79■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.79■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 KDM5CP41229 1560 aa20.78■□□□□ 0.92
BBS1-211ENST00000526815 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 AGLP35573 1532 aa20.76■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.75■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.73■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.73■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.72■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 ABCA6Q8N139 1617 aa20.71■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 NPATQ14207 1427 aa20.71■□□□□ 0.91
BBS1-211ENST00000526815 PLA2R1Q13018 1463 aa20.69■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 PIP4K2BP78356 416 aa20.69■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 AFAP1Q8N556 730 aa20.69■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.69■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 PKD2Q13563 968 aa20.68■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.66■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 MROH2AA6NES4 1674 aa20.66■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 TOM1O60784 492 aa20.65■□□□□ 0.9
BBS1-211ENST00000526815 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.64■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.62■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.62■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.62■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 CPS1P31327 1500 aa20.59■□□□□ 0.89
BBS1-211ENST00000526815 ZMYM3Q14202 1370 aa20.58■□□□□ 0.88
BBS1-211ENST00000526815 KIF14Q15058 1648 aa20.57■□□□□ 0.88
BBS1-211ENST00000526815 PTPRKQ15262 1439 aa20.53■□□□□ 0.88
BBS1-211ENST00000526815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.52■□□□□ 0.88
BBS1-211ENST00000526815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.51■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 ALKQ9UM73 1620 aa20.51■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 ABCC1P33527 1531 aa20.51■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.49■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.48■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
BBS1-211ENST00000526815 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.45■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 CLIP1P30622 1438 aa20.44■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.44■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 PREX2Q70Z35 1606 aa20.43■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 CEP162Q5TB80 1403 aa20.43■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.41■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
BBS1-211ENST00000526815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.39■□□□□ 0.85
BBS1-211ENST00000526815 FMN1Q68DA7 1419 aa20.37■□□□□ 0.85
BBS1-211ENST00000526815 PLXNC1O60486 1568 aa20.37■□□□□ 0.85
BBS1-211ENST00000526815 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.37■□□□□ 0.85
BBS1-211ENST00000526815 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
BBS1-211ENST00000526815 POTEAQ6S8J7 498 aa20.32■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 A2MP01023 1474 aa20.3■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 GGT6Q6P531 493 aa20.3■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 ATP7AQ04656 1500 aa20.3■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.29■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 SYNMO15061 1565 aa20.29■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.28■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.28■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 MED14O60244 1454 aa20.28■□□□□ 0.84
BBS1-211ENST00000526815 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms