RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
MEG3-218ENST00000521812 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.79■■□□□ 1.88
MEG3-218ENST00000521812 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.76■■□□□ 1.87
MEG3-218ENST00000521812 HECW1Q76N89 1606 aa26.76■■□□□ 1.87
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.75■■□□□ 1.87
MEG3-218ENST00000521812 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.73■■□□□ 1.87
MEG3-218ENST00000521812 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.7■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 ATP10AO60312 1499 aa26.69■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.68■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.67■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 STRCQ7RTU9 1775 aa26.67■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.65■■□□□ 1.86
MEG3-218ENST00000521812 PLCH2O75038 1416 aa26.64■■□□□ 1.85
MEG3-218ENST00000521812 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.64■■□□□ 1.85
MEG3-218ENST00000521812 PTPRTO14522 1441 aa26.59■■□□□ 1.85
MEG3-218ENST00000521812 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
MEG3-218ENST00000521812 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.54■■□□□ 1.84
MEG3-218ENST00000521812 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MEG3-218ENST00000521812 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.51■■□□□ 1.83
MEG3-218ENST00000521812 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
MEG3-218ENST00000521812 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.49■■□□□ 1.83
MEG3-218ENST00000521812 AFAP1Q8N556 730 aa26.46■■□□□ 1.83
MEG3-218ENST00000521812 KDM5CP41229 1560 aa26.44■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.42■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 REREQ9P2R6 1566 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 C3P01024 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 NCOA1Q15788 1441 aa26.4■■□□□ 1.82
MEG3-218ENST00000521812 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 EEA1Q15075 1411 aa26.38■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.36■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.34■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 AGLP35573 1532 aa26.34■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 KIF14Q15058 1648 aa26.33■■□□□ 1.81
MEG3-218ENST00000521812 ABCA6Q8N139 1617 aa26.32■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.3■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.29■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 FMN1Q68DA7 1419 aa26.28■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.27■■□□□ 1.8
MEG3-218ENST00000521812 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
MEG3-218ENST00000521812 CLIP1P30622 1438 aa26.24■■□□□ 1.79
MEG3-218ENST00000521812 NPATQ14207 1427 aa26.24■■□□□ 1.79
MEG3-218ENST00000521812 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.23■■□□□ 1.79
MEG3-218ENST00000521812 ABCC1P33527 1531 aa26.19■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.18■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 ZMYM3Q14202 1370 aa26.17■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 PKD2Q13563 968 aa26.16■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.15■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.15■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 MROH2AA6NES4 1674 aa26.14■■□□□ 1.78
MEG3-218ENST00000521812 PLA2R1Q13018 1463 aa26.13■■□□□ 1.77
MEG3-218ENST00000521812 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.12■■□□□ 1.77
MEG3-218ENST00000521812 PREX2Q70Z35 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
MEG3-218ENST00000521812 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MEG3-218ENST00000521812 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
MEG3-218ENST00000521812 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 HSPA1LP34931 641 aa26.06■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.05■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.05■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.05■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.04■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 PTPRKQ15262 1439 aa26.04■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.03■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
MEG3-218ENST00000521812 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 PIP4K2BP78356 416 aa26■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 TOM1O60784 492 aa25.97■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.96■■□□□ 1.75
MEG3-218ENST00000521812 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.95■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 PLXNC1O60486 1568 aa25.95■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.94■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 GGT6Q6P531 493 aa25.93■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 A2MP01023 1474 aa25.92■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 CPS1P31327 1500 aa25.92■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 ATP7AQ04656 1500 aa25.92■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.91■■□□□ 1.74
MEG3-218ENST00000521812 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.87■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.87■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.83■■□□□ 1.73
MEG3-218ENST00000521812 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.82■■□□□ 1.72
MEG3-218ENST00000521812 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
MEG3-218ENST00000521812 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
MEG3-218ENST00000521812 ALKQ9UM73 1620 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms