RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.15□□□□□ -0.3
HERC3-210ENST00000512194 E2F4Q16254 413 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 SMARCA4P51532 1647 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.11□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 MFSD10Q14728 455 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 SMARCA2P51531 1590 aa13.1□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HERC3-210ENST00000512194 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HERC3-210ENST00000512194 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
HERC3-210ENST00000512194 IER5LQ5T953 404 aa13.06□□□□□ -0.32
HERC3-210ENST00000512194 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
HERC3-210ENST00000512194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.04□□□□□ -0.32
HERC3-210ENST00000512194 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 OCEL1Q9H607 264 aa13.02□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 GABBR2O75899 941 aa13.01□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.98□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 CAMK2BQ13554 666 aa12.98□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 MICALL2Q8IY33 904 aa12.98□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
HERC3-210ENST00000512194 POTEHQ6S545 545 aa12.95□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.94□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 PLCG2P16885 1265 aa12.93□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.93□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.93□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 G3V3G9 751 aa12.92□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 WDR62O43379 1518 aa12.9□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.9□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 TMC2Q8TDI7 906 aa12.9□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HERC3-210ENST00000512194 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 SEMA3EO15041 775 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 FOXK1P85037 733 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 SEC24BO95487 1268 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 DSG2Q14126 1118 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 SLC39A7Q92504 469 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HERC3-210ENST00000512194 KIF3CO14782 793 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 C7P10643 843 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 C2orf72A6NCS6 295 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 PLPP6Q8IY26 295 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-210ENST00000512194 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 WIZO95785 1651 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 DPYSL4O14531 572 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 METRNQ9UJH8 293 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 POTEFA5A3E0 1075 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 PDIA6Q15084 440 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 POTEIP0CG38 1075 aa12.71□□□□□ -0.37
HERC3-210ENST00000512194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.7□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.7□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 MAP3K9P80192 1104 aa12.67□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF11O15085 1522 aa12.64□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 OXER1Q8TDS5 423 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 PRDM2Q13029 1718 aa12.62□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 ZMYND10O75800 440 aa12.62□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 CFTRP13569 1480 aa12.6□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D12O60347 775 aa12.59□□□□□ -0.39
HERC3-210ENST00000512194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.58□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 CHD1O14646 1710 aa12.57□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 SLC34A2O95436 690 aa12.56□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 PTGER2P43116 358 aa12.56□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 BARGINQ6ZT62 677 aa12.56□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.54□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
HERC3-210ENST00000512194 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.52□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 ARAP1Q96P48 1450 aa12.52□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
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