RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-208ENST00000511276 STRCQ7RTU9 1775 aa22.74■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 10.1
FAM53C-208ENST00000511276 HECW1Q76N89 1606 aa22.73■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.72■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
FAM53C-208ENST00000511276 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 ATP10AO60312 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
FAM53C-208ENST00000511276 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.63■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.62■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 PTPRTO14522 1441 aa22.58■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 PLCH2O75038 1416 aa22.58■■□□□ 1.21
FAM53C-208ENST00000511276 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.55■■□□□ 1.2
FAM53C-208ENST00000511276 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.55■■□□□ 1.2
FAM53C-208ENST00000511276 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.49■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 C3P01024 1663 aa22.49■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.48■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.46■■□□□ 1.19
FAM53C-208ENST00000511276 KDM5CP41229 1560 aa22.44■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 AFAP1Q8N556 730 aa22.44■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 NCOA1Q15788 1441 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.42■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 REREQ9P2R6 1566 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-208ENST00000511276 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 KIF14Q15058 1648 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ABCA6Q8N139 1617 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 AGLP35573 1532 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-208ENST00000511276 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.33■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 EEA1Q15075 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.27■■□□□ 1.16
FAM53C-208ENST00000511276 NPATQ14207 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 MROH2AA6NES4 1674 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 FMN1Q68DA7 1419 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 CLIP1P30622 1438 aa22.23■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ABCC1P33527 1531 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 ZMYM3Q14202 1370 aa22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FAM53C-208ENST00000511276 PKD2Q13563 968 aa22.2■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 PLA2R1Q13018 1463 aa22.18■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 PREX2Q70Z35 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 HSPA1LP34931 641 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.17■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
FAM53C-208ENST00000511276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PIP4K2BP78356 416 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 PTPRKQ15262 1439 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM53C-208ENST00000511276 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.08■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 TOM1O60784 492 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FAM53C-208ENST00000511276 CPS1P31327 1500 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 GGT6Q6P531 493 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 PLXNC1O60486 1568 aa22■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 36.5
FAM53C-208ENST00000511276 ATP7AQ04656 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 A2MP01023 1474 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.97■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.95■■□□□ 1.11
FAM53C-208ENST00000511276 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 ALKQ9UM73 1620 aa21.93■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.92■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.89■■□□□ 1.1
FAM53C-208ENST00000511276 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.89■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.88■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FAM53C-208ENST00000511276 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.86■■□□□ 1.09
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