RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.88■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 WDR62O43379 1518 aa15.87■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 NUDCQ9Y266 331 aa15.87■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.86■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.85■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 GSE1Q14687 1217 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.84■□□□□ 0.13
PRRX1-207ENST00000497230 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.83■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 ADAMTS12P58397 1594 aa15.83■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.81■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.79■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.79■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.79■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 NFKBIBQ15653 356 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF11O15085 1522 aa15.78■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.77■□□□□ 0.12
PRRX1-207ENST00000497230 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.77■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.77■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.76■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 GRIN2BQ13224 1484 aa15.75■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 MAPKBP1O60336 1514 aa15.72■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 USP35Q9P2H5 1018 aa15.72■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PRRX1-207ENST00000497230 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.69■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.69■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.68■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.68■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.68■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 CRBNQ96SW2 442 aa15.67■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 IFT140Q96RY7 1462 aa15.66■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 BACH2Q9BYV9 841 aa15.66■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.65■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 ARID3AQ99856 593 aa15.65■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC7Q96M83 1385 aa15.65■□□□□ 0.1
PRRX1-207ENST00000497230 IQGAP2Q13576 1575 aa15.64■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 FMN1Q68DA7 1419 aa15.64■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.64■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.63■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.63■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 RGL3Q3MIN7 710 aa15.63■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.61■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.6■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.58■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
PRRX1-207ENST00000497230 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 HECW1Q76N89 1606 aa15.57■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 KIAA0556O60303 1618 aa15.55■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 POGKQ9P215 609 aa15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 DISP1Q96F81 1524 aa15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 NEUROD2Q15784 382 aa15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.53■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PRRX1-207ENST00000497230 BECN1Q14457 450 aa15.52■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 MS4A1P11836 297 aa15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.5■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.5■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 CEP170Q5SW79 1584 aa15.49■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.49■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 FAM161AQ3B820 660 aa15.48■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 GRIN2AQ12879 1464 aa15.48■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 UACAQ9BZF9 1416 aa15.48■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.47■□□□□ 0.07
PRRX1-207ENST00000497230 PKD2Q13563 968 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms