RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496038.1

BCAN-208, Transcript of brevican, humanhuman

TSL 2

Gene BCAN, Length 1,871 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAN-208ENST00000496038 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 ABCA8O94911 1581 aa21.99■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 JPH4Q96JJ6 628 aa21.98■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.97■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 KIF14Q15058 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
BCAN-208ENST00000496038 ARID3CA6NKF2 412 aa21.95■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.95■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.95■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.92■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 ADGRL2O95490 1459 aa21.9■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
BCAN-208ENST00000496038 SHROOM2Q13796 1616 aa21.89■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.89■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.88■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.86■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.86■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.84■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 ATP10BO94823 1461 aa21.84■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 NCOA1Q15788 1441 aa21.84■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 TRIM52Q96A61 297 aa21.83■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
BCAN-208ENST00000496038 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 PZPP20742 1482 aa21.8■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.79■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.79■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 CCER2I3L3R5 266 aa21.77■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
BCAN-208ENST00000496038 KCNH8Q96L42 1107 aa21.75■■□□□ 1.07
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BCAN-208ENST00000496038 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.72■■□□□ 1.07
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BCAN-208ENST00000496038 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.7■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 PTPRGP23470 1445 aa21.7■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.68■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 PREX2Q70Z35 1606 aa21.68■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 FOXD1Q16676 465 aa21.68■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.67■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.67■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.67■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 ANP32CO43423 234 aa21.66■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 MBD5Q9P267 1494 aa21.65■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.65■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.65■■□□□ 1.06
BCAN-208ENST00000496038 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.63■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.62■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.62■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
BCAN-208ENST00000496038 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.6■■□□□ 1.05
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BCAN-208ENST00000496038 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.56■■□□□ 1.04
BCAN-208ENST00000496038 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.56■■□□□ 1.04
BCAN-208ENST00000496038 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.54■■□□□ 1.04
BCAN-208ENST00000496038 CCDC7Q96M83 1385 aa21.53■■□□□ 1.04
BCAN-208ENST00000496038 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
BCAN-208ENST00000496038 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.51■■□□□ 1.03
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BCAN-208ENST00000496038 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.51■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 KIF15Q9NS87 1388 aa21.51■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.51■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.5■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.5■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 TSPY4P0CV99 314 aa21.49■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 TSPY10P0CW01 314 aa21.49■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 NUP155O75694 1391 aa21.48■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 PLXNC1O60486 1568 aa21.47■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 UNC13BO14795 1591 aa21.46■■□□□ 1.03
BCAN-208ENST00000496038 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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BCAN-208ENST00000496038 KDM5CP41229 1560 aa21.45■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.44■■□□□ 1.02
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BCAN-208ENST00000496038 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.43■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.42■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.42■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.4■■□□□ 1.02
BCAN-208ENST00000496038 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.37■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 USP47Q96K76 1375 aa21.36■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.35■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 PLCH2O75038 1416 aa21.34■■□□□ 1.01
BCAN-208ENST00000496038 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.33■■□□□ 1
BCAN-208ENST00000496038 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.33■■□□□ 1
BCAN-208ENST00000496038 ABCC1P33527 1531 aa21.31■■□□□ 1
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