RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494559.5

PDZRN3-211, Transcript of PDZ domain containing ring finger 3, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3, Length 2,080 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-211ENST00000494559 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.42■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 MIER1Q8N108 512 aa22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PDZRN3-211ENST00000494559 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.39■■□□□ 1.17
PDZRN3-211ENST00000494559 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDZRN3-211ENST00000494559 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.34■■□□□ 1.17
PDZRN3-211ENST00000494559 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.34■■□□□ 1.17
PDZRN3-211ENST00000494559 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.33■■□□□ 1.17
PDZRN3-211ENST00000494559 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 TONSLQ96HA7 1378 aa22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 TRIM52Q96A61 297 aa22.31■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 ADGRL2O95490 1459 aa22.3■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 NCOA1Q15788 1441 aa22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.29■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCC2Q92887 1545 aa22.26■■□□□ 1.15
PDZRN3-211ENST00000494559 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.22■■□□□ 1.15
PDZRN3-211ENST00000494559 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3-211ENST00000494559 PREX2Q70Z35 1606 aa22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3-211ENST00000494559 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PDZRN3-211ENST00000494559 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.19■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.17■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 PZPP20742 1482 aa22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 MBD5Q9P267 1494 aa22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.16■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PDZRN3-211ENST00000494559 FOXD1Q16676 465 aa22.14■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 TSPY4P0CV99 314 aa22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 TSPY10P0CW01 314 aa22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3-211ENST00000494559 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.04■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 KIF15Q9NS87 1388 aa22.03■■□□□ 1.12
PDZRN3-211ENST00000494559 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.03■■□□□ 1.12
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PDZRN3-211ENST00000494559 PLCH2O75038 1416 aa21.98■■□□□ 1.11
PDZRN3-211ENST00000494559 KCNH8Q96L42 1107 aa21.98■■□□□ 1.11
PDZRN3-211ENST00000494559 PKD2Q13563 968 aa21.97■■□□□ 1.11
PDZRN3-211ENST00000494559 NUP155O75694 1391 aa21.96■■□□□ 1.11
PDZRN3-211ENST00000494559 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.94■■□□□ 1.1
PDZRN3-211ENST00000494559 PLXNC1O60486 1568 aa21.93■■□□□ 1.1
PDZRN3-211ENST00000494559 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.92■■□□□ 1.1
PDZRN3-211ENST00000494559 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCC1P33527 1531 aa21.89■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.89■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.89■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.88■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 UNC13BO14795 1591 aa21.88■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.87■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.86■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.83■■□□□ 1.09
PDZRN3-211ENST00000494559 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.82■■□□□ 1.08
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PDZRN3-211ENST00000494559 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.81■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.81■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.79■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 ERBINQ96RT1 1412 aa21.78■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.78■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 ANP32CO43423 234 aa21.78■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.77■■□□□ 1.08
PDZRN3-211ENST00000494559 CCER2I3L3R5 266 aa21.76■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 ASXL2Q76L83 1435 aa21.75■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.74■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.72■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 CCDC7Q96M83 1385 aa21.72■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 FANCAO15360 1455 aa21.72■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 PLA2R1Q13018 1463 aa21.71■■□□□ 1.07
PDZRN3-211ENST00000494559 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PDZRN3-211ENST00000494559 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.69■■□□□ 1.06
PDZRN3-211ENST00000494559 AFAP1Q8N556 730 aa21.69■■□□□ 1.06
PDZRN3-211ENST00000494559 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
PDZRN3-211ENST00000494559 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.68■■□□□ 1.06
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