RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.54■■□□□ 1.36
SYP-208ENST00000494396 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYP-208ENST00000494396 HFM1A2PYH4 1435 aa23.51■■□□□ 1.35
SYP-208ENST00000494396 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.51■■□□□ 1.35
SYP-208ENST00000494396 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYP-208ENST00000494396 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.49■■□□□ 1.35
SYP-208ENST00000494396 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 NAIPQ13075 1403 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 AKNAQ7Z591 1439 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 DAPK1P53355 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 ABCC5O15440 1437 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYP-208ENST00000494396 BCL11AQ9H165 835 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 ROCK1Q13464 1354 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 NEFLP07196 543 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 CCER2I3L3R5 266 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-208ENST00000494396 PREX2Q70Z35 1606 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 FKBP8Q14318 412 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.3■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 KCNH8Q96L42 1107 aa23.29■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.28■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.27■■□□□ 1.32
SYP-208ENST00000494396 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.26■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 ADGRL2O95490 1459 aa23.24■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.24■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.24■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.23■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 KDM6BO15054 1643 aa23.23■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.23■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 NCOA1Q15788 1441 aa23.22■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.22■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.22■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.22■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.21■■□□□ 1.31
SYP-208ENST00000494396 MBD5Q9P267 1494 aa23.2■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 PLCH2O75038 1416 aa23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 TSPY4P0CV99 314 aa23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 TSPY10P0CW01 314 aa23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.18■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 TRIM52Q96A61 297 aa23.17■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.17■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.16■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
SYP-208ENST00000494396 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.14■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 ASXL2Q76L83 1435 aa23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 ANP32CO43423 234 aa23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 BCANQ96GW7 911 aa23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.12■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.12■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.11■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-208ENST00000494396 TONSLQ96HA7 1378 aa23.08■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.07■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 KIF15Q9NS87 1388 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 ABCC1P33527 1531 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.03■■□□□ 1.28
SYP-208ENST00000494396 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 FANCAO15360 1455 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 PZPP20742 1482 aa22.97■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 PLXNC1O60486 1568 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-208ENST00000494396 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.95■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.94■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.92■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 FOXD1Q16676 465 aa22.91■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 NUP155O75694 1391 aa22.91■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.9■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 ADGRL1O94910 1474 aa22.89■■□□□ 1.26
SYP-208ENST00000494396 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.89■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 CD109Q6YHK3 1445 aa22.88■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.88■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 MSH5O43196 834 aa22.88■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.87■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 AFAP1Q8N556 730 aa22.87■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SYP-208ENST00000494396 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
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