RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491635.1

GTPBP4-205, Transcript of GTP binding protein 4, human

TSL 2

Gene GTPBP4, Length 2,220 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP4-205	ENST00000491635	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP4-205	ENST00000491635	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GTPBP4-205	ENST00000491635	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANP32C	O43423	234 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.81	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	KIF14	Q15058	1648 aa		13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	ABCA8	O94911	1581 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GTPBP4-205	ENST00000491635	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	PZP	P20742	1482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP4-205	ENST00000491635	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	ATP10B	O94823	1461 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	FBLN2	P98095	1184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	FOXD1	Q16676	465 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GTPBP4-205	ENST00000491635	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	CHD1	O14646	1710 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	PTPRG	P23470	1445 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	NEFL	P07196	543 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GTPBP4-205	ENST00000491635	KDM5C	P41229	1560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	PKD2	Q13563	968 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	FKBP8	Q14318	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	NUP155	O75694	1391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	USP47	Q96K76	1375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	UNC13B	O14795	1591 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.53	□□□□□ -0.24
GTPBP4-205	ENST00000491635	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.52	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25	5e-8	■■■■□ 21.9
GTPBP4-205	ENST00000491635	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GTPBP4-205	ENST00000491635	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP4-205	ENST00000491635	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP4-205	ENST00000491635	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GTPBP4-205	ENST00000491635		E9PCH4	1651 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GTPBP4-205	ENST00000491635	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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