RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488620.5

RGS3-223, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best)

Gene RGS3, Length 1,725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-223	ENST00000488620	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.08	■■■□□ 2.09
RGS3-223	ENST00000488620	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.06	■■■□□ 2.08
RGS3-223	ENST00000488620	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
RGS3-223	ENST00000488620	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RGS3-223	ENST00000488620	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RGS3-223	ENST00000488620	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	ABCC2	Q92887	1545 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.97	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RGS3-223	ENST00000488620	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	KDM6B	O15054	1643 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RGS3-223	ENST00000488620	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RGS3-223	ENST00000488620	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RGS3-223	ENST00000488620	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RGS3-223	ENST00000488620	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RGS3-223	ENST00000488620	MIER1	Q8N108	512 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RGS3-223	ENST00000488620	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.76	■■■□□ 2.04
RGS3-223	ENST00000488620	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.76	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.75	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	PZP	P20742	1482 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
RGS3-223	ENST00000488620	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	PLCH2	O75038	1416 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RGS3-223	ENST00000488620	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RGS3-223	ENST00000488620	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RGS3-223	ENST00000488620	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.57	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.57	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		27.57	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		27.56	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	FOXD1	Q16676	465 aa		27.55	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	NUP155	O75694	1391 aa		27.55	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.54	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.53	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.53	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	PKD2	Q13563	968 aa		27.52	■■■□□ 2
RGS3-223	ENST00000488620	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		27.49	■■□□□ 1.99
RGS3-223	ENST00000488620	ABCC1	P33527	1531 aa		27.46	■■□□□ 1.99
RGS3-223	ENST00000488620	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	27.45	■■□□□ 1.99
RGS3-223	ENST00000488620	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.44	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.44	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.43	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	UNC13B	O14795	1591 aa		27.42	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.42	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.42	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.4	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
RGS3-223	ENST00000488620	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.39	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		27.34	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.34	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.34	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.33	■■□□□ 1.97
RGS3-223	ENST00000488620	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		27.31	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	ASXL2	Q76L83	1435 aa		27.31	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.31	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.31	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.29	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	27.29	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	FANCA	O15360	1455 aa		27.28	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	ANP32C	O43423	234 aa		27.28	■■□□□ 1.96
RGS3-223	ENST00000488620	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
RGS3-223	ENST00000488620	ATP10A	O60312	1499 aa		27.26	■■□□□ 1.95
RGS3-223	ENST00000488620	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.23	■■□□□ 1.95
RGS3-223	ENST00000488620	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.23	■■□□□ 1.95
RGS3-223	ENST00000488620	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.2	■■□□□ 1.94
RGS3-223	ENST00000488620	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		27.19	■■□□□ 1.94
RGS3-223	ENST00000488620	ADGRL1	O94910	1474 aa		27.17	■■□□□ 1.94
RGS3-223	ENST00000488620	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.17	■■□□□ 1.94
RGS3-223	ENST00000488620	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.16	■■□□□ 1.94
RGS3-223	ENST00000488620	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.16	■■□□□ 1.94

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