RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478721.5

MEGF11-209, Transcript of multiple EGF like domains 11, human

TSL 2

Gene MEGF11, Length 909 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF11-209	ENST00000478721	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEGF11-209	ENST00000478721	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.9	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	NEO1	Q92859	1461 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEGF11-209	ENST00000478721	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.8	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	TOM1	O60784	492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MEGF11-209	ENST00000478721	ABCA8	O94911	1581 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF11-209	ENST00000478721	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	APLP2	Q06481	763 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	ATP10B	O94823	1461 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	ATP10A	O60312	1499 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MEGF11-209	ENST00000478721	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	PKD2	Q13563	968 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF11-209	ENST00000478721	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	C3	P01024	1663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	CPS1	P31327	1500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEGF11-209	ENST00000478721	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	KIF14	Q15058	1648 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	NPAT	Q14207	1427 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
MEGF11-209	ENST00000478721	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	AGL	P35573	1532 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
MEGF11-209	ENST00000478721	PLCH2	O75038	1416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.39	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.38	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MEGF11-209	ENST00000478721	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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