RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTPRM	P28827	1452 aa		14.12	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF21B	O75037	1637 aa		14.12	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		14.12	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARID3C	A6NKF2	412 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RAPGEF3	O95398	923 aa		14.11	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAMD9	Q5K651	1589 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		14.09	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		14.08	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AKNA	Q7Z591	1439 aa		14.07	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FANCA	O15360	1455 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		14.06	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		14.05	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		14.04	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		14.03	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		14.01	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLCH2	O75038	1416 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP10A	O60312	1499 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CLIP1	P30622	1438 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POTEH	Q6S545	545 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	APLP2	Q06481	763 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MLEC	Q14165	292 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA2	P54652	639 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF14	Q15058	1648 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM5C	P41229	1560 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PTPRT	O14522	1441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AGL	P35573	1532 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NPAT	Q14207	1427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCC1	P33527	1531 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SOCS7	O14512	581 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PKD2	Q13563	968 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C3	P01024	1663 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23

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