RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 DAPK1P53355 1430 aa25.48■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.47■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.45■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 ABCC5O15440 1437 aa25.45■■□□□ 1.67
HPS3-202ENST00000460120 FKBP8Q14318 412 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 JPH4Q96JJ6 628 aa25.42■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.42■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 CCER2I3L3R5 266 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
HPS3-202ENST00000460120 CEP170Q5SW79 1584 aa25.39■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 AKNAQ7Z591 1439 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.36■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 SYNJ2O15056 1496 aa25.34■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HPS3-202ENST00000460120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.31■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 ROCK1Q13464 1354 aa25.3■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 KIF14Q15058 1648 aa25.29■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.29■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.28■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS3-202ENST00000460120 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 NEFLP07196 543 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 CCDC184Q52MB2 194 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 PKD2Q13563 968 aa25.23■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 NCOA1Q15788 1441 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS3-202ENST00000460120 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 PZPP20742 1482 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 NUP160Q12769 1436 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 CCDC7Q96M83 1385 aa25.16■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.14■■□□□ 1.62
HPS3-202ENST00000460120 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.14■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 ATP10BO94823 1461 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.11■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 NUP155O75694 1391 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 TSPY4P0CV99 314 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 TSPY10P0CW01 314 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.09■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 MRS2Q9HD23 443 aa25.09■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HPS3-202ENST00000460120 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.07■■□□□ 1.6
HPS3-202ENST00000460120 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.06■■□□□ 1.6
HPS3-202ENST00000460120 PTPRGP23470 1445 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS3-202ENST00000460120 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS3-202ENST00000460120 ABCA8O94911 1581 aa25.02■■□□□ 1.6
HPS3-202ENST00000460120 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 ADCY10Q96PN6 1610 aa25■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 ADGRL2O95490 1459 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 USP47Q96K76 1375 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 KIF15Q9NS87 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.96■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.95■■□□□ 1.59
HPS3-202ENST00000460120 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.94■■□□□ 1.58
HPS3-202ENST00000460120 RGL3Q3MIN7 710 aa24.91■■□□□ 1.58
HPS3-202ENST00000460120 MBD5Q9P267 1494 aa24.88■■□□□ 1.57
HPS3-202ENST00000460120 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS3-202ENST00000460120 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.83■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.8■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.8■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.79■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.79■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS3-202ENST00000460120 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 KDM5CP41229 1560 aa24.74■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.74■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.74■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.73■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.72■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.72■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.72■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 TMC1Q8TDI8 760 aa24.7■■□□□ 1.55
HPS3-202ENST00000460120 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.7■■□□□ 1.54
HPS3-202ENST00000460120 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.7■■□□□ 1.54
HPS3-202ENST00000460120 PREX2Q70Z35 1606 aa24.69■■□□□ 1.54
HPS3-202ENST00000460120 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.69■■□□□ 1.54
HPS3-202ENST00000460120 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.69■■□□□ 1.54
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