RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445297.5

ARHGEF16-205, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 16, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF16, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF16-205ENST00000445297 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.08■■■■□ 3.53
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ARHGEF16-205ENST00000445297 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF16-205ENST00000445297 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF16-205ENST00000445297 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.99■■■■□ 3.51
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ARHGEF16-205ENST00000445297 ATP10AO60312 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
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ARHGEF16-205ENST00000445297 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.59■■■■□ 3.45
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ARHGEF16-205ENST00000445297 MAP3K1Q13233 1512 aa36.5■■■■□ 3.43
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ARHGEF16-205ENST00000445297 REREQ9P2R6 1566 aa36.48■■■■□ 3.43
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ARHGEF16-205ENST00000445297 C3P01024 1663 aa36.44■■■■□ 3.42
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ARHGEF16-205ENST00000445297 ABCC1P33527 1531 aa36.35■■■■□ 3.41
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ARHGEF16-205ENST00000445297 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
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ARHGEF16-205ENST00000445297 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.88■■■■□ 3.33
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ARHGEF16-205ENST00000445297 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.84■■■■□ 3.33
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