RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432008.1

HTATSF1P1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene HTATSF1P1, Length 984 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.52■□□□□ 0.56
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 HECW1Q76N89 1606 aa18.51■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MLECQ14165 292 aa18.49■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.49■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.49■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 P3H3Q8IVL6 736 aa18.47■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PTPRTO14522 1441 aa18.46■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.46■□□□□ 0.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.43■□□□□ 0.54
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ATP10AO60312 1499 aa18.42■□□□□ 0.54
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.38■□□□□ 0.53
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.38■□□□□ 0.53
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
HTATSF1P1-201ENST00000432008 C3P01024 1663 aa18.34■□□□□ 0.53
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NCOA1Q15788 1441 aa18.32■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 REREQ9P2R6 1566 aa18.32■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PLCH2O75038 1416 aa18.32■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.31■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.31■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 KDM5CP41229 1560 aa18.3■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.29■□□□□ 0.52
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCA6Q8N139 1617 aa18.25■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.24■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 AGLP35573 1532 aa18.23■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.23■□□□□ 0.51
HTATSF1P1-201ENST00000432008 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.2■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.2■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.2■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 KIF14Q15058 1648 aa18.2■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.18■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MROH2AA6NES4 1674 aa18.18■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NPATQ14207 1427 aa18.16■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.16■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PLA2R1Q13018 1463 aa18.14■□□□□ 0.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.14■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.13■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 AFAP1Q8N556 730 aa18.12■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.11■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCC1P33527 1531 aa18.11■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.1■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CLIP1P30622 1438 aa18.07■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.07■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.07■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PREX2Q70Z35 1606 aa18.07■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.06■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PKD2Q13563 968 aa18.06■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 EEA1Q15075 1411 aa18.05■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 HSPA1LP34931 641 aa18.04■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 FMN1Q68DA7 1419 aa18.04■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CPS1P31327 1500 aa18.03■□□□□ 0.48
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.01■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ZMYM3Q14202 1370 aa18■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 TOM1O60784 492 aa17.97■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PIP4K2BP78356 416 aa17.97■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PTPRKQ15262 1439 aa17.97■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PLXNC1O60486 1568 aa17.96■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.96■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HTATSF1P1-201ENST00000432008 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.95■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.94■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.93■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.92■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.92■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.9■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ATP7AQ04656 1500 aa17.9■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.9■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ALKQ9UM73 1620 aa17.9■□□□□ 0.46
HTATSF1P1-201ENST00000432008 A2MP01023 1474 aa17.87■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.87■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.86■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SYNMO15061 1565 aa17.83■□□□□ 0.45
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.83■□□□□ 0.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.79■□□□□ 0.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DEPDC5O75140 1603 aa17.79■□□□□ 0.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MSH5O43196 834 aa17.78■□□□□ 0.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 GGT6Q6P531 493 aa17.78■□□□□ 0.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 TNRQ92752 1358 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms