RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
CERS1-201ENST00000429504 ABCA8O94911 1581 aa39.51■■■■□ 3.92
CERS1-201ENST00000429504 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.49■■■■□ 3.91
CERS1-201ENST00000429504 KIF14Q15058 1648 aa39.48■■■■□ 3.91
CERS1-201ENST00000429504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.44■■■■□ 3.9
CERS1-201ENST00000429504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
CERS1-201ENST00000429504 TRIM52Q96A61 297 aa39.41■■■■□ 3.9
CERS1-201ENST00000429504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
CERS1-201ENST00000429504 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.41■■■■□ 3.9
CERS1-201ENST00000429504 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.38■■■■□ 3.89
CERS1-201ENST00000429504 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.36■■■■□ 3.89
CERS1-201ENST00000429504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
CERS1-201ENST00000429504 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.31■■■■□ 3.88
CERS1-201ENST00000429504 ATP10BO94823 1461 aa39.29■■■■□ 3.88
CERS1-201ENST00000429504 CHD1O14646 1710 aa39.29■■■■□ 3.88
CERS1-201ENST00000429504 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
CERS1-201ENST00000429504 ADGRL2O95490 1459 aa39.28■■■■□ 3.88
CERS1-201ENST00000429504 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.25■■■■□ 3.87
CERS1-201ENST00000429504 NCOA1Q15788 1441 aa39.22■■■■□ 3.87
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.22■■■■□ 3.87
CERS1-201ENST00000429504 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.18■■■■□ 3.86
CERS1-201ENST00000429504 SHROOM2Q13796 1616 aa39.16■■■■□ 3.86
CERS1-201ENST00000429504 PTPRGP23470 1445 aa39.16■■■■□ 3.86
CERS1-201ENST00000429504 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
CERS1-201ENST00000429504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.12■■■■□ 3.85
CERS1-201ENST00000429504 PZPP20742 1482 aa39.09■■■■□ 3.85
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.09■■■■□ 3.85
CERS1-201ENST00000429504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
CERS1-201ENST00000429504 FOXD1Q16676 465 aa39.05■■■■□ 3.84
CERS1-201ENST00000429504 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
CERS1-201ENST00000429504 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.04■■■■□ 3.84
CERS1-201ENST00000429504 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.01■■■■□ 3.84
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF5Q12774 1597 aa39■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 KCNH8Q96L42 1107 aa38.99■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 PREX2Q70Z35 1606 aa38.97■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 CCER2I3L3R5 266 aa38.97■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.96■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.96■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 ANP32CO43423 234 aa38.96■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
CERS1-201ENST00000429504 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.94■■■■□ 3.82
CERS1-201ENST00000429504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.91■■■■□ 3.82
CERS1-201ENST00000429504 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
CERS1-201ENST00000429504 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP38.89■■■■□ 3.82
CERS1-201ENST00000429504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
CERS1-201ENST00000429504 MBD5Q9P267 1494 aa38.85■■■■□ 3.81
CERS1-201ENST00000429504 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.85■■■■□ 3.81
CERS1-201ENST00000429504 ABCC2Q92887 1545 aa38.84■■■■□ 3.81
CERS1-201ENST00000429504 TSPY4P0CV99 314 aa38.8■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 TSPY10P0CW01 314 aa38.8■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.79■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.79■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 WASHC2AQ641Q2 1341 aa38.79■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.76■■■■□ 3.8
CERS1-201ENST00000429504 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.75■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.75■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 KIF15Q9NS87 1388 aa38.74■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 PKD2Q13563 968 aa38.73■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.72■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.71■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
CERS1-201ENST00000429504 NUP155O75694 1391 aa38.69■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.68■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.68■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.65■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.64■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.64■■■■□ 3.78
CERS1-201ENST00000429504 CCDC7Q96M83 1385 aa38.61■■■■□ 3.77
CERS1-201ENST00000429504 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.6■■■■□ 3.77
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.59■■■■□ 3.77
CERS1-201ENST00000429504 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.57■■■■□ 3.77
CERS1-201ENST00000429504 PLXNC1O60486 1568 aa38.54■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.52■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.51■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 UNC13BO14795 1591 aa38.51■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
CERS1-201ENST00000429504 KDM5CP41229 1560 aa38.44■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.43■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 OSCARQ8IYS5 282 aa38.43■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 PLCH2O75038 1416 aa38.42■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 KIF7Q2M1P5 1343 aa38.41■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 USP47Q96K76 1375 aa38.39■■■■□ 3.74
CERS1-201ENST00000429504 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.36■■■■□ 3.73
CERS1-201ENST00000429504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.35■■■■□ 3.73
CERS1-201ENST00000429504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.35■■■■□ 3.73
CERS1-201ENST00000429504 ABCC1P33527 1531 aa38.33■■■■□ 3.73
CERS1-201ENST00000429504 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.3■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 ERBINQ96RT1 1412 aa38.29■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.28■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.27■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
CERS1-201ENST00000429504 CCDC144AA2RUR9 1427 aa38.23■■■■□ 3.71
CERS1-201ENST00000429504 PLA2R1Q13018 1463 aa38.17■■■■□ 3.7
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